应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 求助功能基因建库OTU划分
31/1返回列表
查看: 535  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

452201796

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 求助功能基因建库OTU划分 已有1人参与

小弟最近在做功能基因的系统发育树构建，一般16S OTU划分基本都是97%的相似度为标准，功能基因也是如此吗？

一般功能基因只是扩增了部分片段，我目前有300左右的正确克隆子，按97%的标准来划分OTU有150多个，这样庞大的系统发育树根本无法呈现，翻译成氨基酸之后建树改进不大，跪求大侠相助啊，小弟不甚感激！
回复此楼

» 猜你喜欢
stay hungry，stay foolish，stay young，stay alive
1楼 2013-03-31 21:23:08
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

2012xin

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我现在也在做克隆文库，请问你是如何划分OTU的？谢谢
赞一下 回复此楼
2楼2014-04-01 10:06:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

452201796

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 2012xin at 2014-04-01 10:06:55
我现在也在做克隆文库，请问你是如何划分OTU的？谢谢

97%
3楼2014-04-01 10:52:12
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 452201796 的主题更新
31/1返回列表
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭