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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 求助功能基因建库OTU划分
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452201796

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 求助功能基因建库OTU划分 已有1人参与

小弟最近在做功能基因的系统发育树构建，一般16S OTU划分基本都是97%的相似度为标准，功能基因也是如此吗？

一般功能基因只是扩增了部分片段，我目前有300左右的正确克隆子，按97%的标准来划分OTU有150多个，这样庞大的系统发育树根本无法呈现，翻译成氨基酸之后建树改进不大，跪求大侠相助啊，小弟不甚感激！
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stay hungry，stay foolish，stay young，stay alive
1楼 2013-03-31 21:23:08
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2012xin

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我现在也在做克隆文库，请问你是如何划分OTU的？谢谢
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2楼2014-04-01 10:06:55
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452201796

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 2012xin at 2014-04-01 10:06:55
我现在也在做克隆文库，请问你是如何划分OTU的？谢谢

97%
3楼2014-04-01 10:52:12
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