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xzx018

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 细菌基因组

有没有做细菌基因组测序的虫子，想问下现在用454和illumina测草图的价格差别好像蛮大的，测出来的数据会不会差别蛮大的？不知道测出来之后对后续分析影响有多大，对后面想发的文章影响有多大啊，谢谢大家
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1楼 2013-03-29 10:17:37
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sunjiankc

铁虫 (初入文坛)
★ ★ ★
xzx018(金币+2): 谢谢参与
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-03-30 10:31:52
Illumina测序片段短，错率高。只有后续分析，这种项目一般都是公司给出报告，发文章的话主要还是看你的菌是否够吸引人。比如从人体大脑中分出一个菌的话估计怎么测都能发NSC。。。。
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5楼2013-03-29 11:22:14
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lcat

木虫 (小有名气)
★
xzx018(金币+2): 谢谢参与
其实两种方法都可以的。一般来说，454的覆盖率低，但拼接出来的片段较长。Illumina覆盖率高，但可能gap多一些。据我所知细菌基因组（仅以基因组分析作为主要内容）发文章的话一般需要完成图，需要自己手工补gap。

其实有个简单的办法，楼主分别跟推荐这两种方法的公司沟通一下这些顾虑，听听他们怎么鄙视另外一种方法的，自己掂量掂量就行啦
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10楼2013-03-29 15:28:52
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foolmonkey

新虫 (知名作家)
★
xzx018(金币+2): 谢谢参与
太深奥，坐等高人。
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6楼2013-03-29 15:15:19
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syhorchid

木虫之王 (文学泰斗)
★
xzx018(金币+2): 谢谢参与
也来学习一下
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8楼2013-03-29 15:26:47
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hmgujiaqi

铁虫 (小有名气)
★
xzx018(金币+2): 谢谢参与
加油
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12楼2013-03-29 15:32:32
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限量版好男儿

铜虫 (著名写手)
努力加油
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15楼2013-03-29 15:34:01
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假大空

木虫之王 (文学泰斗)
★
xzx018(金币+2): 谢谢参与
学习来了
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20楼2013-03-29 16:14:10
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userhung

禁虫 (文学泰斗)
★
xzx018(金币+2): 谢谢参与
片段有点短，代表度不高~~~~~~~~~~
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21楼2013-03-29 16:20:04
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neu234

木虫之王 (文学泰斗)
★
xzx018(金币+2): 谢谢参与
专业不对口，不懂
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22楼2013-03-29 16:23:03
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哈哈大姑爷

至尊木虫 (知名作家)
★
xzx018(金币+2): 谢谢参与
加油
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33楼2013-03-29 19:00:43
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shinyzd

木虫之王 (文学泰斗)
★
xzx018(金币+2): 谢谢参与
帮顶
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40楼2013-03-29 21:14:10
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zhangxingc2楼
2013-03-29 10:22   回复  
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tianchi29523楼
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flyxu4楼
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readytogo7楼
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zhenwuhuang9楼
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ruifenghaha11楼
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