应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » discover 计算。。。老是半路error怎么回事啊。。
51/1返回列表
查看: 949  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

Zr891002

金虫 (小有名气)

[求助] discover 计算。。。老是半路error怎么回事啊。。

是不是要把那个deviation 设置的大一点啊。。。但是这个deviation是什么意思啊。。设置大了会不会不准啊。。


Error: Dynamics: Energy difference between successive steps in dynamics is greater than the user defined variable DEVIATION,  5000.000
    invoked from within
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
加油，一定能成功
1楼 2013-03-28 09:32:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuqiang2270

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Zr891002 at 2013-03-28 10:24:50
我已经最小化过了啊。。。我试过forcite的几何优化 也失败，也试过discover 的最小化。。。。还是这样

我是不是应该先用NVE跑一段时间平衡然后再用NPT计算？ 这样会不会好点？...

一般我们优化过之后就行了的。 可能是你优化的时间不够 再优化下试试， 要是不行的话就退火试试 在做动力学。
先做NVE在用NPT这个没这么做过。。。
赞一下 回复此楼
4楼2013-03-28 20:33:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

liuqiang2270

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
体系能量太高 先优化能量最小化
赞一下 回复此楼
2楼2013-03-28 10:11:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Zr891002

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuqiang2270 at 2013-03-28 10:11:56
体系能量太高 先优化能量最小化

我已经最小化过了啊。。。我试过forcite的几何优化 也失败，也试过discover 的最小化。。。。还是这样

我是不是应该先用NVE跑一段时间平衡然后再用NPT计算？ 这样会不会好点？
赞一下 回复此楼
加油，一定能成功
3楼2013-03-28 10:24:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

upc穆宁

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liuqiang2270 at 2013-03-28 20:33:08
一般我们优化过之后就行了的。 可能是你优化的时间不够 再优化下试试， 要是不行的话就退火试试 在做动力学。
先做NVE在用NPT这个没这么做过。。。...

亲，这个退火是什么意思？也是降低体系能量吗？在我的理解中将体系最小化之后，直接跑动力学不行吗？我是小白我为自己代言，不要喷我
赞一下 回复此楼
5楼2013-03-29 12:07:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 366求调剂 +9 不知名的小卅 2026-04-11 9/450 2026-04-13 01:19 by 幸免 ..
[考研] 一志愿中南大学 0855 机械 286 求调剂 +10 不会吃肉 2026-04-12 10/500 2026-04-12 22:51 by 零零二
[考研] 材料考研调剂 +27 云木达达 2026-04-11 29/1450 2026-04-12 22:48 by kyle12138
[考研] 085600材料与化工，求调剂 +12 won_qii 2026-04-07 12/600 2026-04-12 17:02 by lhj2009
[考研] 297求调剂 +17 ORCHID1 2026-04-10 18/900 2026-04-12 09:59 by zhouwenxian
[考研] 316求调剂 +5 想读研究生( ?∵ 2026-04-07 5/250 2026-04-12 00:43 by 蓝云思雨
[考研] 22408调剂315分 +3 zhuangyan123 2026-04-09 3/150 2026-04-12 00:25 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂 +18 MAX怅惘 2026-04-09 20/1000 2026-04-11 23:31 by zhen～
[考研] 调剂求助 +6 果然有我 2026-04-11 7/350 2026-04-11 16:22 by 明月此时有
[考研] 求调剂 +3 胃痉挛累了 2026-04-11 5/250 2026-04-11 14:13 by luhong1990
[考研] 材料与化工调剂 10+11 下一站上岸@ 2026-04-10 36/1800 2026-04-11 10:26 by 89436494
[考研] 284求调剂 +9 让我上岸吧阿西 2026-04-09 11/550 2026-04-10 19:18 by 靖jing
[考研] 278求调剂 +27 范婷娜 2026-04-07 31/1550 2026-04-09 20:49 by zhouxiaoyu
[考研] 0703化学求调剂 +21 不知名的小卅 2026-04-08 21/1050 2026-04-09 18:55 by l_paradox
[考研] 二次调剂求老师收留 +3 笑笑袁 2026-04-08 3/150 2026-04-08 23:50 by 醉在风里
[考研] 生物学328分求调剂 +9 闪电kkl 2026-04-08 10/500 2026-04-08 21:42 by liuhuiying09
[考研] 一志愿吉大化学327求调剂 +12 王王白石 2026-04-06 13/650 2026-04-08 16:05 by luoyongfeng
[考研] 275 求调剂 +8 Lei812514 2026-04-07 8/400 2026-04-08 12:46 by chemisry
[考研] 22408 266求调剂 +11 masss11222 2026-04-07 14/700 2026-04-08 11:06 by yulian1987
[考研] 287分求调剂 有专利国奖一志愿哈工大085406 +6 白易辰 2026-04-06 7/350 2026-04-06 22:46 by 875465
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭