应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 关于使用geom=allcheck出的问题
81/1返回列表
查看: 5327  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

skysky112211

木虫 (小有名气)

NaNa

[求助] 关于使用geom=allcheck出的问题

按要求，使用两种方法计算分子结构，使用geom=allcheck关键词，但是在使用自定义基组是总是出错，求助
输入文件

%nprocshared=6
%mem=4000MB
%chk=b2-t-1.chk
# opt=tight bp86/gen guess=read geom=allcheck

Title Card Required

0 3
C                 -0.00000200    0.27131700   -1.46951000
C                  0.00000000   -0.99052200   -0.76267400
C                  0.00000100   -1.02937800    0.69457900
C                  0.00000200    0.19207200    1.46972000
C                  0.00000100    1.45622100    0.76251200
C                 -0.00000100    1.49460000   -0.69276400
H                 -0.00000400    0.30561900   -2.56297700
H                 -0.00000100   -1.93249700   -1.32024700
H                  0.00000200   -1.99973600    1.20106900
H                  0.00000400    0.16618800    2.56344900
H                  0.00000100    2.39340900    1.32870600
H                 -0.00000200    2.46076600   -1.20807600
Co                 1.63701400    0.21299200   -0.00005400
Co                -1.63701400    0.21299200   -0.00004900
C                 -3.23345100   -0.49337800   -0.00055800
O                 -4.31931900   -0.95879100   -0.00022900
C                  3.23345200   -0.49337800   -0.00055800
O                  4.31931900   -0.95879100   -0.00022500

Co 0
S 5 1.00
       270991.000000000     0.000310000
        39734.800000000     0.002420000
         9057.460000000     0.012380000
         2598.210000000     0.048490000
          868.200000000     0.146720000
S 1 1.00
          323.431000000     1.000000000
S 1 1.00
          130.860000000     1.000000000
S 1 1.00
           56.121900000     1.000000000
S 1 1.00
           18.921900000     1.000000000
S 1 1.00
            7.952380000     1.000000000
S 1 1.00
            2.197540000     1.000000000
S 1 1.00
            0.846713000     1.000000000
S 1 1.00
            0.122266000     1.000000000
S 1 1.00
            0.044172000     1.000000000
P 4 1.00
         1636.210000000     0.002960000
          390.903000000     0.023360000
          127.884000000     0.103430000
           49.241300000     0.279540000
P 1 1.00
           20.751200000     1.000000000
P 1 1.00
            9.203680000     1.000000000
P 1 1.00
            3.817790000     1.000000000
P 1 1.00
            1.587620000     1.000000000
P 1 1.00
            0.624660000     1.000000000
P 1 1.00
            0.245800000     1.000000000
P 1 1.00
            0.096700000     1.000000000
D 4 1.00
           44.977400000     0.026270000
           12.569000000     0.141820000
            4.244220000     0.359420000
            1.443300000     0.466130000
D 1 1.00
            0.449965000     1.000000000
D 1 1.00
            0.121900000     1.000000000
****
C 0
S 6 1.00
   4232.610000000    0.002029000
    634.882000000    0.015535000
    146.097000000    0.075411000
     42.497400000    0.257121000
     14.189200000    0.596555000
      1.966600000    0.242517000
S 1 1.00
      5.147700000    1.000000000
S 1 1.00
      0.496200000    1.000000000
S 1 1.00
      0.153300000    1.000000000
P 4 1.00
     18.155700000    0.018534000
      3.986400000    0.115442000
      1.142900000    0.386206000
      0.359400000    0.640089000
P 1 1.00
      0.114600000    1.000000000
D 1  1.00
       0.75000000    1.00000000
****
H 0
S    3 1.00
   .1924060000D+02   .3282800000D-01
   .2899200000D+01   .2312080000D+00
   .6534000000D+00   .8172380000D+00
S    1 1.00
   .1776000000D+00   .1000000000D+01
P    1 1.00
   .7500000000D+00   .1000000000D+01
****
O 0
S 6 1.00
   7816.540000000    0.002031000
   1175.820000000    0.015436000
    273.188000000    0.073771000
     81.169600000    0.247606000
     27.183600000    0.611832000
      3.413600000    0.241205000
S 1 1.00
      9.532200000    1.000000000
S 1 1.00
      0.939800000    1.000000000
S 1 1.00
      0.284600000    1.000000000
P 4 1.00
     35.183200000    0.019580000
      7.904000000    0.124189000
      2.305100000    0.394727000
      0.717100000    0.627375000
P 1 1.00
      0.213700000    1.000000000
D 1  1.00
       0.85000000        1.00000000
****



错误信息，
General basis read from cards:  (5D, 7F)
Unrecognized atomic symbol Title
Error termination via Lnk1e in /public/gauss/g09/l301.exe
使用3-21g基组是没有问题，基组是直接复制以前计算好了的，
请帮忙，谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

过渡态计算

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
NaNa
1楼 2013-03-26 22:30:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
skysky112211: 金币+8, ★★★★★最佳答案, 非常感谢 2013-03-29 22:50:30
既然你都指定了Geom=allcheck,那就是说所有的几何信息都从check file里面去读.所以,如果你确定要用geom=allcheck, 那么就把那个Title 那个 0 3 以及那些所有的坐标全部删除掉..让他直接去读后面的基组信息就是了.
现在的错误就是当他想读基组信息的时候,先是读到你的Title,然后读到你的电荷数和多重度,接着读下去还是坐标,系统被你逼疯了....
赞一下 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2013-03-27 05:34:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
另外不看好你这个结构.Co价层10个电子,羰基配位过来2个,一共12个. 两个Co公用苯的6个电子,各自形成18电子稳定结构, 如果能够存在,则基态的多重度为1. 你做的这个是优化后的三重激发态? 难道你想算磷光?
赞一下 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
3楼2013-03-27 05:44:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skysky112211

木虫 (小有名气)

NaNa
%nprocshared=6
%mem=4000MB
%chk=b2-t-1.chk
# opt=tight freq b3lyp/gen guess=read geom=allcheck

新做的输入文件，错误信息
General basis read from cards:  (5D, 7F)
End of file reading basis center.
Error termination via Lnk1e in /public/gauss/g09/l301.exe
赞一下 回复此楼
NaNa
4楼2013-03-27 23:40:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skysky112211

木虫 (小有名气)

NaNa
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangmt at 2013-03-27 05:44:13
另外不看好你这个结构.Co价层10个电子,羰基配位过来2个,一共12个. 两个Co公用苯的6个电子,各自形成18电子稳定结构, 如果能够存在,则基态的多重度为1. 你做的这个是优化后的三重激发态? 难道你想算磷光?

只是简单地完成单三重态，没有一定意义，Co是9电子，还是错误了，谢谢
赞一下 回复此楼
NaNa
5楼2013-03-27 23:42:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
哇.惭愧,电子数都数错了..
那个geom=allcheck并不包含基组信息,所以你的基组信息别删掉.
# opt=tight freq b3lyp/gen guess=read geom=allcheck
                                    <--------------------别忘了这中间有个空行
Co 0
S 5 1.00
       270991.000000000     0.000310000
.........
****

<------------结尾处别忘了多给几个空行..
赞一下 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
6楼2013-03-28 05:15:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skysky112211

木虫 (小有名气)

NaNa
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhangmt at 2013-03-28 05:15:23
哇.惭愧,电子数都数错了..
那个geom=allcheck并不包含基组信息,所以你的基组信息别删掉.
# opt=tight freq b3lyp/gen guess=read geom=allcheck
                                    <------------------- ...

好像可以了 谢谢
回复此楼
NaNa
7楼2013-03-29 22:50:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

plxu

金虫 (初入文坛)
你已经给出初始的结构坐标了，为什么还要加入geom=allcheck,check是指读取历史检查点文件中的优化后结构！？
赞一下 回复此楼
8楼2015-01-21 16:29:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 skysky112211 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭