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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 模拟计算紫外光谱时,审稿人的关于温度的问题,我问一下.
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zhficcas

银虫 (正式写手)

[求助] 模拟计算紫外光谱时,审稿人的关于温度的问题,我问一下.

最近投了一篇论文, 其中对紫外光谱模拟的部分,审稿人提出了一个问题,如下:
It seems that the TDDFT calculation in the paper is at zero temperature.
But the experimental measurement is usually not performed at zero temperature.
So, what is the temperature effect?
呵呵,用了很长时间的TDDFT,对温度我倒没有设定, 不知道高斯软件中默认的是298.15K, 还是在零度计算的呢? 高斯手册中倒是说进行频率分析的时候,如果在输入栏没有特别设定, 软件默认是在298.15K下分析的, 但我们进行TDDFT模拟紫外光谱的时候,如果输入栏不做设定, 那温度是多少了,应该也是298.15K吧.谢谢.
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1楼 2012-11-06 16:07:36
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
★
cenwanglai: 金币+1, 希望是常温。能设置成其他温度不？ 2012-11-07 09:50:48
我记得也是常温。 难道记错了？ 智商开始捉鸡了
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
2楼2012-11-07 09:11:51
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zhficcas

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2012-11-07 09:11:51
我记得也是常温。 难道记错了？ 智商开始捉鸡了

对分子进行频率分析时可以通过设置命令修改的(见高斯03手册),但模拟光谱的时候,就不知道是否是常温了.本人感觉我们不设置的话, 应该就是常温下的模拟,但审稿人为什么会这样问呢, 不明白?
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3楼2012-11-07 11:59:54
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果你这个东西不是很费时，可以加上温度关键词。
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莫强求！
4楼2012-11-07 15:29:10
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2012-11-07 09:11:51
我记得也是常温。 难道记错了？ 智商开始捉鸡了

# HF/6-31G(d) Geom=Check Guess=Read Freq=(ReadFC,ReadIsotopes)
Frequencies at 300 K
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
5楼2012-11-07 17:28:11
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by jiewei at 2012-11-07 17:28:11
# HF/6-31G(d) Geom=Check Guess=Read Freq=(ReadFC,ReadIsotopes)
Frequencies at 300 K...

这是频率计算哈， 如果是紫外或者激发态你就写成这样吧
# HF/6-31G(d)  RTemp=300 Geom=Check Guess=Read
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
6楼2012-11-07 17:31:45
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zhficcas

银虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jiewei at 2012-11-07 17:31:45
这是频率计算哈， 如果是紫外或者激发态你就写成这样吧
# HF/6-31G(d)  RTemp=300 Geom=Check Guess=Read...

我们在模拟紫外光谱时,如下写法:
# geom=allcheck guess=read genchk pbe1pbe/genecp td(nstates=40) scrf=(
pcm, read, solvent=acetonitrile)
是否是模拟常温下的? 和下面的加上温度的是否一样呢
# geom=allcheck guess=read RTemp=298.15 genchk pbe1pbe/genecp td(nstates=40) scrf=( pcm, read, solvent=acetonitrile)
难道要运算一下, 看看?
谢谢交流!
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7楼2012-11-07 18:07:05
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
引用回帖:
7楼: Originally posted by zhficcas at 2012-11-07 18:07:05
我们在模拟紫外光谱时,如下写法:
# geom=allcheck guess=read genchk pbe1pbe/genecp td(nstates=40) scrf=(
pcm, read, solvent=acetonitrile)
是否是模拟常温下的? 和下面的加上温度的是否一样呢
# geom=a ...

那你运行一下试试吧
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
8楼2012-11-07 18:22:09
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zhficcas

银虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by jiewei at 2012-11-07 18:22:09
那你运行一下试试吧...

老兄, 无法运行, 输入格式有问题, 高斯03不认RTemp 这个关键词, 如何办?
Gaussian 03:  IA32W-G03RevE.01 11-Sep-2007
                08-Nov-2012
******************************************
%chk=Re-2-fluorence-opt-pop(aceton)
%mem=1200mb
Default route:  MaxDisk=70gb
----------------------------------------------------------------------
# geom=check guess=read RTemp=300 genchk pbe1pbe/genecp td(nstates=40) scrf=(pcm, read, solvent=acetonitrile)
----------------------------------------------------------------------
  QPERR --- A SYNTAX ERROR WAS DETECTED IN THE INPUT LINE.
om=check guess=read ,RTemp=300 genchk pbe
  Last state="GCL"
TCursr= 1020 LCursr=   24
Error termination via Lnk1e in e:\ga03\l1.exe at Thu Nov 08 15:34:51 2012.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      7 Int=      0 D2E=      0 Chk=     21 Scr=      1
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9楼2012-11-08 15:43:13
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by zhficcas at 2012-11-08 15:43:13
老兄, 无法运行, 输入格式有问题, 高斯03不认RTemp 这个关键词, 如何办?
Gaussian 03:  IA32W-G03RevE.01 11-Sep-2007
                08-Nov-2012
******************************************
%chk=Re-2 ...

那你把 RTemp=300
换成temperature=300
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10楼2012-11-08 16:37:58
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