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lgc020305

银虫 (正式写手)


[交流] 老板说G09做UV-vis模拟直接依据气态优化构型计算?、、??

如题,老板说做UV-vis模拟要直接依据气态下的优化结构,不能用溶剂模型的优化结构进行TD计算,这样对吗?我不是很赞同。
求大侠解释。

以老板的说法:step1. #  opt freq scf(conver=7,maxcyc=256)
                      step 2. #pbepbe/6-31g(d) td(nstates=50) scrf(smd,solvent=water)
为什么step1不是#  opt freq scf(conver=7,maxcyc=256) scrf(smd,solvent=water)
老板的意思好像是用scrf只是一个模型,并不表示在溶剂中优化。
他坚持用气态优化结构计算UV-vis。
我说用气态优化结构计算UV-vis是错的,他很生气。
问题是:UV-vis模拟时,构型到底用不用scrf溶剂模型优化?还是直接使用气态优化好的结构?
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)


★ ★ ★ ★
lgc020305(金币+1): 谢谢参与
lgc020305: 金币+1, 确实不能直接说老板错啊。老虎的屁股不好摸!!我记住了啊 2013-03-27 04:24:03
gmy1990: 金币+2 2013-03-29 06:36:50
老板的意思好像是用scrf只是一个模型,并不表示在溶剂中优化。——你们老板还停留在G03的认识上,那个时候的SCRF确实对于优化不太理想,G09改善了,溶剂中的优化更合理,梯度计算更好。
他坚持用气态优化结构计算UV-vis。——这个也不一定是错的,前几年限于计时,认为溶剂对几何影响很小,所以首选就是去气相的几何。
我说用气态优化结构计算UV-vis是错的,他很生气。——你说老板是错的,能不生气吗?要说的委婉一些。你的观点是对的,在溶液中测得UV,当然符合实际的就是溶液中优化几何,然后溶液中TD。
额外话:不要说老板是错的,要委婉输出老板的观点是不合适的。
2楼2013-03-26 08:05:47
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南飞探

禁虫 (正式写手)


lgc020305(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽

5楼2013-03-26 16:25:06
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
其实,解决这个问题的最好方法,就是两种方法都算一次
6楼2013-03-28 15:20:12
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lgc020305

银虫 (正式写手)


引用回帖:
6楼: Originally posted by coolrainbow at 2013-03-28 15:20:12
其实,解决这个问题的最好方法,就是两种方法都算一次

我正在算。
老板说我浪费CPU的时间???!!
7楼2013-03-29 05:10:45
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by lgc020305 at 2013-03-29 05:10:45
我正在算。
老板说我浪费CPU的时间???!!...

你老板也有些太固执了。即使算了,将来也可以放到文章中讨论,浪费不了多大时间。

实际上,近些年的工作中,相当多的人在计算溶液中的能量时都是在气相下优化的,不会再在溶液中重新优化结构(Chem. Eur. J. 2012, 18, 9955 – 9964)。溶液下重新优化的也有,但比较少( Chem. Eur. J. 2011, 17, 5060 – 5067)。
8楼2013-03-30 17:55:18
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fyz72323楼
2013-03-26 08:58   回复  
lgc020305(金币+1): 谢谢参与
haixiawu4楼
2013-03-26 15:07   回复  
lgc020305(金币+1): 谢谢参与
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