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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 环境 » 环境生态 » 请教下用过canoco的前辈们个简单的问题
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唐本本

新虫 (小有名气)

[求助] 请教下用过canoco的前辈们个简单的问题

本人刚接触canoco，准备先做RDA再做pRDA，样品为不同位置的共3个位置（A、B、C），同一个位置的取样只有6个，DGGE条带还是有24个，我现在想对3个位置分开做RDA，完了发现p=1，是不是因为样品太少所以RDA分析没有意义呢？如果我把ABC混在一起做的话，p=0.014，这样的数据我该怎么处理呢...

另外想问一下RDA图的各种箭头是表示神马都...插个图

RDA.jpg
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1楼 2013-03-20 22:00:42
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lhd2004

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
TonyGeN: 金币+1, 感谢参与交流 欢迎常来 2013-03-22 08:40:29
唐本本: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢~ 2013-03-23 21:44:04
反映一定的生态梯度,能够解释植被或植物种分布与环境因子之间的关系
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努力做好科研！
2楼2013-03-22 08:38:17
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唐本本

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lhd2004 at 2013-03-22 08:38:17
反映一定的生态梯度,能够解释植被或植物种分布与环境因子之间的关系

还请问一下，我出来的图是samples 和 environment的关系图，样品点到环境因子的投影点的不同位置说明的是什么问题? 就是下图这个蓝色的线与moisture的交点的含义~谢谢~

1.jpg
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3楼2013-03-22 13:53:24
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匿名

用户注销 (小有名气)
本帖仅楼主可见
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4楼2013-04-26 22:15:14
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erbudong

新虫 (初入文坛)
请问种与环境的相关系数能达到1吗
**** Summary ****

Axes                                            1             2             3             4        Total variance

Eigenvalues                       :         0.373         0.279         0.132         0.108                1.000
Species-environment correlations  :         1.000         1.000         1.000         1.000
Cumulative percentage variance
    of species data                :          37.3          65.1          78.3          89.1
    of species-environment relation:          37.3          65.1          78.3          89.1
第二行相关系数都是100%  可能吗  麻烦各位了
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5楼2014-04-15 17:12:17
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er66668888

铜虫 (初入文坛)
问楼主个简单问题 你那DGGE什么数据做的这个啊
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6楼2015-03-03 14:35:15
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taoyan007

铜虫 (初入文坛)
你好，我问一下，你当时弄明白p为什么等于1了吗，我也遇到了，我的样方数量是4个，蒙特卡洛检验p=1，f=0，求回复啊
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路遥知马力
7楼2016-02-24 23:35:14
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taoyan007

铜虫 (初入文坛)
有的回答说，样本的数量一定要大于环境因子的数量，要不然就会出现这种情况，不知道对不对。
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路遥知马力
8楼2016-02-24 23:47:05
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