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星星杨

铜虫 (初入文坛)


[交流] 就鉴别双歧杆菌

哪位大侠做过用16S鉴别双歧杆菌啊?用细菌通用引物能做吗?谢谢!
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taoqi1986918

铜虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
15楼: Originally posted by 星星杨 at 2013-03-22 08:37:30
本人不是专门研究分子的,还麻烦大侠说一下MIX,降落PCR是什么东东?...

降落PCR(touchdown PCR),一种PCR技术,主要用于PCR的条件的优化。在许多情况下引物的设计使得PCR难以进行,例如特异性不够易错配等。退火温度过高会使PCR效率过低,但退火温度过低则会使非特异扩增过多。这虽然可以通过反复尝试来优化,但费时费力。降落PCR提供了一个较为简易的优化方法。其原理大致是这样的。首先在较高的温度下扩增,此时虽然扩增效率低,但非特异扩增基本没有。随着退火温度的降低,非特异扩增会逐步增多。但由于此时特异的扩增产物已经达到一定的数量优势,因此会对非特异扩增产生强烈的竞争抑制,从而大幅提高PCR的特异性和效率。这一PCR技术已经大量地进入医疗临床应用。现在,以高通量PCR为基础的检测方法、如人的 HLA分型 大多采用这一技术。
设计多循环反应的程序,以使相连循环的退火温度越来越低。由于开始时的退火温度选择为高于估计的Tm值,随着循环的进行,退火温度逐渐降到Tm值,并最终低于这个水平,用于确保第一个引物—模板杂交事件发生在最互补的反应物之间,即那些产生目的扩增产物的反应物之间。尽管退火温度最终会降到非特异杂交的Tm值,但此时目的扩增产物已开始几何扩增,在剩下的循环中处于超过任何滞后(非特异)PCR产物的地位。
说白了就是先提高退火温度,将目的片段扩增出来,然后逐渐降低退火温度,这样做的好处就是能够减少非特异性条带的扩增。

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18楼2013-03-22 15:47:16
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freerain

禁虫 (职业作家)


星星杨(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽

2楼2013-03-20 10:54:41
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星星杨

铜虫 (初入文坛)


引用回帖:
2楼: Originally posted by freerain at 2013-03-20 10:54:41
16S 通用引物就可以哈

我这几天在做16S双歧杆菌的鉴定,刚开始跑没条带,后来好不容易有了,可又好多条带,郁闷啊!可否帮我分析一下啊?谢谢啊!条件是:
94度    4分钟
94度   30秒
55度   30秒
72度   2分钟
30个循环
72度  10分钟
梯度PCR也做了,条带也很多,这么办啊?

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  • 2013-03-20 16:37:31, 646 K
3楼2013-03-20 16:42:04
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tianhome

木虫 (知名作家)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
朋友,我没做过鉴定,但理论上讲,用通用引物是没问题的。先试试用刚刚提取出来的基因组作模板,如果还不行,就换个taq酶吧。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2013-03-21 05:42:49
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2013-03-20 17:12   回复  
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