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[交流]
就鉴别双歧杆菌
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哪位大侠做过用16S鉴别双歧杆菌啊?用细菌通用引物能做吗?谢谢! |
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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降落PCR(touchdown PCR),一种PCR技术,主要用于PCR的条件的优化。在许多情况下引物的设计使得PCR难以进行,例如特异性不够易错配等。退火温度过高会使PCR效率过低,但退火温度过低则会使非特异扩增过多。这虽然可以通过反复尝试来优化,但费时费力。降落PCR提供了一个较为简易的优化方法。其原理大致是这样的。首先在较高的温度下扩增,此时虽然扩增效率低,但非特异扩增基本没有。随着退火温度的降低,非特异扩增会逐步增多。但由于此时特异的扩增产物已经达到一定的数量优势,因此会对非特异扩增产生强烈的竞争抑制,从而大幅提高PCR的特异性和效率。这一PCR技术已经大量地进入医疗临床应用。现在,以高通量PCR为基础的检测方法、如人的 HLA分型 大多采用这一技术。 设计多循环反应的程序,以使相连循环的退火温度越来越低。由于开始时的退火温度选择为高于估计的Tm值,随着循环的进行,退火温度逐渐降到Tm值,并最终低于这个水平,用于确保第一个引物—模板杂交事件发生在最互补的反应物之间,即那些产生目的扩增产物的反应物之间。尽管退火温度最终会降到非特异杂交的Tm值,但此时目的扩增产物已开始几何扩增,在剩下的循环中处于超过任何滞后(非特异)PCR产物的地位。 说白了就是先提高退火温度,将目的片段扩增出来,然后逐渐降低退火温度,这样做的好处就是能够减少非特异性条带的扩增。 |
18楼2013-03-22 15:47:16
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星星杨(金币+1): 谢谢参与
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本帖内容被屏蔽 |
2楼2013-03-20 10:54:41
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我这几天在做16S双歧杆菌的鉴定,刚开始跑没条带,后来好不容易有了,可又好多条带,郁闷啊!可否帮我分析一下啊?谢谢啊!条件是: 94度 4分钟 94度 30秒 55度 30秒 72度 2分钟 30个循环 72度 10分钟 梯度PCR也做了,条带也很多,这么办啊? |
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2013-03-20 16:37:31, 646 K
3楼2013-03-20 16:42:04
7楼2013-03-21 05:42:49
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2013-03-20 17:12
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星星杨