查看: 1953  |  回复: 15
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

liuxiuaza

金虫 (正式写手)

[求助] ChIP实验 已有2人参与

本人刚开始做ChIP实验,实验中阴性对照组、不加抗体组和实验组一样都出现了阳性条带,而且Input cotrol样品的条带相对暗很多,现在不知道从哪里分析了,是哪里出了问题?还请各位高手指点

[ Last edited by silicare on 2014-2-26 at 16:34 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuxiuaza

金虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by jk_xdx at 2013-03-21 16:59:21
应该补充一点,超声的时候别超得太碎了,如果超得太过了,PCR扩增的循环数就得增加,这样得到的数据准确性比较差;另外出带很常见,只是它们的亮度应该差很多才对。

是的,不过现在的情况是,阴性对照比实验组的条带要亮,也不知道哪里出了问题,是不是琼脂糖Beads特异性不好还是我选取的目的蛋白特异性不好?
9楼2013-03-22 08:44:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

hy_sandra

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liuxiuaza: 金币+3 2013-03-19 08:54:02
你的陰性對照組用的是什麼,怎麼會有不加抗體組,通常不加抗體的只有input,又ip用的是什麼beads,也許你說清楚點,才能幫你

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
科研是無止盡的
2楼2013-03-18 21:49:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuxiuaza

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hy_sandra at 2013-03-18 21:49:09
你的陰性對照組用的是什麼,怎麼會有不加抗體組,通常不加抗體的只有input,又ip用的是什麼beads,也許你說清楚點,才能幫你

阴性抗体是用的别的无关抗体,因为阴性抗体组也出现了阳性条带,我不知道是什么原因,就不加抗体也做了一遍,结果也出现了阳性条带,IP我用的是santa Cruz的Protein A/G PLUSAgarose。我是先用1%的甲醛进行交联,然后加甘氨酸终止,加裂解液然后超声,超声后的样品取上清,取一定蛋白浓度的样品加Protein A/G PLUSAgarose进行Preclear除去非特异性的蛋白,离心取上清加抗体过夜,再加Protein A/G PLUSAgarose进行沉淀,对沉淀复合物洗涤后,加洗脱缓冲液洗脱并解交联,离心取得上清是我的样品,然后用酚/氯仿抽提,乙醇沉淀。还请您多多指点,在下先谢过了,不胜感激!
3楼2013-03-19 08:53:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hy_sandra

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
liuxiuaza: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-03-19 12:25:22
gyesang: 金币+2, 鼓励应助! 2013-03-21 11:18:31
liuxiuaza: 金币+1 2013-03-22 08:45:44
???E???????????]????????}??????????c???????]?????????????w?????IgG???????????????rat?????????rat IgG, ???^?v??@??????????F?l????????????????S?????????magnetic beads???u?u??????y??agarose beads????????????^??Q??chip??????е?????К?????????????????????F??]??phenol chloroform????DNA????????????r?????К??????@??sample?g???`???????????

[ ????????? http://muchong.com/3g ]
科研是無止盡的
4楼2013-03-19 11:43:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见