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kanminbad

金虫 (小有名气)

[求助] 请问怎样才可以快速的讲距离矩阵转变为z矩阵坐标或者直角坐标体系?


实在没办法只得要自己写点小程序?
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gmy1990

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【答案】应助回帖

首先建立gaussview的输入文件,用ultraedit或者文本编辑器都行,file.com or file.gjf,然后gaussview打开保存的时候有选项write cartesian,笛卡尔坐标就是你要的直角坐标了
4楼2013-03-13 14:14:26
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gmy1990

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【答案】应助回帖

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用gaussview保存的时候有选项,默认的是write cartesians
2楼2013-03-13 12:31:39
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kanminbad

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gmy1990 at 2013-03-13 12:31:39
用gaussview保存的时候有选项,默认的是write cartesians

我的意思是,譬如现在有个距离矩阵:
-----------------------
                   Distance matrix (angstroms):
                    1          2          3          4
     1  O    0.000000
     2  C    1.130000   0.000000
     3  H    2.208302   1.100000   0.000000
     4  H    2.399328   1.702939   1.300000   0.000000
-----------------------
怎么转换或计算成直角坐标系?
现成的软件最好。
3楼2013-03-13 13:37:32
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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kanminbad: 金币+2, 有帮助, 专家就是专家,回答的不错,至于这个课题嘛。。。写程序其实不如用matlab处理简单吧?呵呵 2013-03-15 20:19:23
gmy1990: 金币+1 2013-03-15 21:27:40
本以为这个问题不太难,想着可以动手写个程序试试看,分析后才发现,这个很有挑战性啊。
除了需要判断一些特殊无解的情况以外,还要考虑诸多的近似以及效率问题,所以简单搜了一下文献,
才发现这是个很不错的课题。。。推荐两篇文献你读读看吧。当然,有用的肯定不止这俩,提供个线索而已。
93年JCC的一篇Kentucky大学数学系的论文,Glunt,W., Hayden, T. L. and Raydan, M. J. Comput Chem. 14(1), 114–120.(1993),
以及03年JGO一篇Iowa大学生物系的论文,Dong, Q.; Wu, Z., J. Global Optimization 2002, 22, 365-375.
你看完了自己写个程序共享上来吧,
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
5楼2013-03-13 15:32:24
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