应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » Gromacs运行时itp文件语法出错
51/1返回列表
查看: 2754  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

何处re尘埃

铜虫 (初入文坛)

[求助] Gromacs运行时itp文件语法出错

[moleculetype]
; molname       exclusions
CPP       1

[ atoms ]
;id type resnr residu atom cgnr   charge
1    P5     1     ARG     BAS     1     0   
2    N0     1     ARG     SI1     2     0   
3    Qd     1     ARG     SI2     3     1.0   
4    P5     1     ARG     BAS     4     0   
5    N0     1     ARG     SI1     5     0   
6    Qd     1     ARG     SI2     6     1.0
7    P5     1     ARG     BAS     7     0   
8    N0     1     ARG     SI1     8     0   

Source code file: topio.c, line: 654

Fatal error:
Syntax error - File CPP.itp, line 1
Last line read:
'[moleculetype]'
Invalid order for directive moleculetype
求教是怎么回事啊
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Gromacs

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-03-13 11:08:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxy964777869

铜虫 (正式写手)
★
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流，出一次这样的错误，对彼此都有警醒作用 2013-03-19 21:30:21
最近刚看了gromacs的error目录，楼主遇到的问题赫然在列，
，我也为我的无知感到不好意思。
赞一下 回复此楼
3楼2013-03-19 20:58:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

zxy964777869

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-03-13 20:19:29
何处re尘埃: 金币+5, ★有帮助, 不是这个问题，不过还是谢谢了 2013-03-19 15:40:31
中括号与moleculatype字段之间有一个空格。
如下：

[ moleculetype ]      ；两端各空出一个空格
; Name            nrexcl
Other               3
赞一下 回复此楼
2楼2013-03-13 16:50:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

看这里：
http://www.gromacs.org/Documenta ... r_for_directive_xxx

检查你们的 .top  文件
看看.top  文件里有没有正确的引用 itp 文件，
#include
赞一下 回复此楼
4楼2013-03-19 21:28:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cplove

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

月只蓝: 非应助，请勿选择应助回帖 2013-12-02 09:25:10
请问楼主 这个问题你解决了吗 怎么解决的啊？
赞一下 回复此楼
只有和高手比较才知道自己的无知！
5楼2013-12-01 20:30:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 4/200 2026-11-11 08:12 by 1Nb0IVlmV6v0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 07:06 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 5/250 2026-11-11 07:03 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:29 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:23 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:12 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-11 01:24 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:10 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:02 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-10 20:12 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 申请环境，微生物方向博士 +3 浅笑09 2026-11-08 3/150 2026-11-10 12:44 by 可淡不可忘
[考博] 27博士申请 +3 白白白ly 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:39 by szq0819
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 08:00 by IhnEQauGmT3K
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭