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genebank 提交序列时候，要一个 Assembly Method
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genebank 提交序列时候，要一个 Assembly Method ,请问这个Assembly Method具体是什么，一般填什么，乱填了一个，结果被打回来了。 We have received 5 sequence submission(s) from you with the following information: > Assembly Method :: CAP v. 3 > Sequencing Technology :: 454 If your sequences represent computer-generated mRNA assemblies then they should be resubmitted to the Transcriptome Shotgun Assembly (TSA) database. The complete TSA submission instructions are below. If your sequences are not computationally assembled then please let us know. We will delete your submissions from our database if we do not receive a response from you by Mar 20, 2013. |
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niil
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【答案】应助回帖
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Assembly Method：序列组装的方法 Sequencing Technology :测序的技术，如第一代测序，第二代测序 一般提交的基因是基本上是第一代测序得到的序列，通过片段重叠组装起来的。你填的454平台是第二代测序平台，是高通量的分析平台， 获得的原始数据通过计算机组装后得到unigenes，高通量的测序结果有专门的数据库TSA。 他们是问你的序列是不是 computer-generated mRNA assemblies，如果是的话就得提交到TSA。 这两两项不是必填答案。你可以回复序列不是computer-generated mRNA assemblies。省的麻烦了。 |
2楼2013-03-08 09:50:07