应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 土壤DNA功能基因的遗传多样性研究
101/1返回列表
查看: 1523  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lhf903

金虫 (正式写手)

[求助] 土壤DNA功能基因的遗传多样性研究

我最近在做土壤总DNA的功能基因，做了DGGE，但图谱上的条带数较少，达不到分析要求，想问一下各位，有没有什么方法可以提高条带数目；亦或是有什么其他方法分析遗传多样性，T-RFLP可以吗
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-03-06 10:27:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

scnu2008

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhang8826857: 金币+3, 新虫加油 2013-03-07 08:58:27
lhf903: 金币+4 2013-03-09 17:43:09
条带数目少的，可以试试降低电压和增加电泳时间。或者做一下该功能基因的绝对定量realtime-pcr，看会不会在环境中本来就少，如果本来就少的，可以增加模板浓度。
赞一下 回复此楼
2楼2013-03-06 22:43:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leichenliu

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可能是你选的功能基因比较保守，序列多样性较低，建议楼主参考下别人的工作，看是否也是多样性不高。做realtime-PCR只是检测该基因的数量，不能检测它的序列多样性，而DGGE是检测序列多样性的，这两个实验技术不是一回事。
赞一下 回复此楼
3楼2013-03-07 13:08:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lhf903

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by scnu2008 at 2013-03-06 22:43:17
条带数目少的，可以试试降低电压和增加电泳时间。或者做一下该功能基因的绝对定量realtime-pcr，看会不会在环境中本来就少，如果本来就少的，可以增加模板浓度。

谢谢
回复此楼
4楼2013-03-07 14:10:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lhf903

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by leichenliu at 2013-03-07 13:08:54
可能是你选的功能基因比较保守，序列多样性较低，建议楼主参考下别人的工作，看是否也是多样性不高。做realtime-PCR只是检测该基因的数量，不能检测它的序列多样性，而DGGE是检测序列多样性的，这两个实验技术不是一 ...

谢谢
回复此楼
5楼2013-03-07 14:10:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lhf903

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by leichenliu at 2013-03-07 13:08:54
可能是你选的功能基因比较保守，序列多样性较低，建议楼主参考下别人的工作，看是否也是多样性不高。做realtime-PCR只是检测该基因的数量，不能检测它的序列多样性，而DGGE是检测序列多样性的，这两个实验技术不是一 ...

可不可以用二次pcr的方法，以pcr产物为模版~
赞一下 回复此楼
6楼2013-03-08 13:08:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leichenliu

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
lhf903: 金币+6 2013-03-09 09:20:28
引用回帖:
6楼: Originally posted by lhf903 at 2013-03-08 13:08:07
可不可以用二次pcr的方法，以pcr产物为模版~...

条带多寡不是PCR方法的问题，可能是你的引物不好，不是通用性较差，所以PCR产物序列多样性不高，导致DGGE条带少。
赞一下 回复此楼
7楼2013-03-08 16:54:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lhf903

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by leichenliu at 2013-03-08 16:54:51
条带多寡不是PCR方法的问题，可能是你的引物不好，不是通用性较差，所以PCR产物序列多样性不高，导致DGGE条带少。...

换过几种常用引物，条带都很很少，怀疑是目的基因在样品中较少，达不到DGGE的检测限~
赞一下 回复此楼
8楼2013-03-08 17:44:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leichenliu

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by lhf903 at 2013-03-08 17:44:11
换过几种常用引物，条带都很很少，怀疑是目的基因在样品中较少，达不到DGGE的检测限~...

这种情况也有可能
赞一下 回复此楼
9楼2013-03-08 17:50:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

快乐酒僧

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by scnu2008 at 2013-03-06 22:43:17
条带数目少的，可以试试降低电压和增加电泳时间。或者做一下该功能基因的绝对定量realtime-pcr，看会不会在环境中本来就少，如果本来就少的，可以增加模板浓度。

那请问做纯菌DGGE条带有五六条之多又该咋办呢？考虑可能有多拷贝、异源双链等问题。但也不会那么多啊  我做的是细菌 用的338f 518r 做的V3区 扩增。求解答！
赞一下 回复此楼
10楼2013-05-14 17:58:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lhf903 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 什么时候开奖？ +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 07:41 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 zjuhero 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭