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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 知道miRNA的成熟序列，怎么查找它的前体序列啊？
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没入尘埃5

金虫 (小有名气)

[求助] 知道miRNA的成熟序列，怎么查找它的前体序列啊？

谢谢了！
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如果不努力，肯定没收获！
1楼 2013-03-05 12:21:03
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
没入尘埃5(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-04-28 17:34:45
sanger的mirbase查，http://www.mirbase.org/知道microRNA的名字或者不知道都行
不知道的在这里输入序列
http://www.mirbase.org/search.shtml
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3楼2013-03-05 16:33:00
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koala0224

新虫 (初入文坛)
您好，打扰一下，你知道如何得到成熟miRNA的前体序列了吗？我现在也是面临同样的问题。能帮忙解决一下吗？非常感谢。
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20楼2016-12-06 21:59:58
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以发过来我给你找找看
如果涉及保密就算了，
primicroRNA大小应该在170bp左右
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没入尘埃5
8楼2013-03-07 08:31:41
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yesali

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
没入尘埃5(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-04-28 17:34:36
NCBI上去blust比对，或者去miRbase去查，好多数据库给出了成熟序列和发夹结构序列
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2楼2013-03-05 13:30:10
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没入尘埃5

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yesali at 2013-03-05 13:30:10
NCBI上去blust比对，或者去miRbase去查，好多数据库给出了成熟序列和发夹结构序列

我是指miRbase里面没有的miRNA，现在只预测到成熟序列的
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4楼2013-03-06 08:41:30
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没入尘埃5

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cdl007 at 2013-03-05 16:33:00
sanger的mirbase查，http://www.mirbase.org/知道microRNA的名字或者不知道都行
不知道的在这里输入序列
http://www.mirbase.org/search.shtml

是自己预测的，知道了成熟序列，怎么知道前提序列啊？
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5楼2013-03-06 08:42:31
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

输入，blast比对，
可以在基因组上找，不过相对来说比较烦
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6楼2013-03-06 09:05:56
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没入尘埃5

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by cdl007 at 2013-03-06 09:05:56
输入，blast比对，
可以在基因组上找，不过相对来说比较烦

弱弱地说，还是不知道怎么找，望指点啊！
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7楼2013-03-06 18:09:24
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没入尘埃5

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by cdl007 at 2013-03-07 08:31:41
可以发过来我给你找找看
如果涉及保密就算了，
primicroRNA大小应该在170bp左右

谢谢了！TGAGAAGGTAGATCATAATAGC，那你先帮我看看这个吧，看能不能找到
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如果不努力，肯定没收获！
9楼2013-03-07 17:48:57
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没入尘埃5

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by cdl007 at 2013-03-07 08:31:41
可以发过来我给你找找看
如果涉及保密就算了，
primicroRNA大小应该在170bp左右

是小麦里的
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如果不努力，肯定没收获！
10楼2013-03-07 17:49:41
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