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知道miRNA的成熟序列,怎么查找它的前体序列啊?
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楼
1970-01-01 08:00:00
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编辑
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(super robot)
我们都爱小木虫
找到一些相关的精华帖子,希望有用哦~
一段序列(不是基因,是非编码RNA)怎么知道都有哪些miRNA可能作用于他呢?
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cdl007
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【答案】应助回帖
输入,blast比对,
可以在基因组上找,不过相对来说比较烦
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6楼
2013-03-06 09:05:56
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yesali
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2013-04-28 17:34:36
NCBI上去blust比对,或者去miRbase去查,好多数据库给出了成熟序列和发夹结构序列
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2楼
2013-03-05 13:30:10
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2013-04-28 17:34:45
sanger的mirbase查,
http://www.mirbase.org/
知道microRNA的名字或者不知道都行
不知道的在这里输入序列
http://www.mirbase.org/search.shtml
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3楼
2013-03-05 16:33:00
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2楼
:
Originally posted by
yesali
at 2013-03-05 13:30:10
NCBI上去blust比对,或者去miRbase去查,好多数据库给出了成熟序列和发夹结构序列
我是指miRbase里面没有的miRNA,现在只预测到成熟序列的
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如果不努力,肯定没收获!
4楼
2013-03-06 08:41:30
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