24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1197  |  回复: 13

shuaiblue

银虫 (小有名气)

[求助] 急!晶体中的结晶水数目与分子式的不符

我用降低空间群的方法解一个晶体,结构中有一个完整的结晶水(但是grow之后还是一个完整的,不是应该有两个结晶水了吗?),cif文件中的分子式显示的是2H2O,请大家帮忙解决一下,这是怎么回事?如何把另一个结晶水找出来呢?谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ifent

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shuaiblue: 金币+5 2013-03-04 21:44:47
grow 不出来没问题啊,你那个水是游离的吧,当然不会grow出来了.......
你的找出来是啥意思,如果只是画图的话,用对称操作就可以显示出来了。
2楼2013-03-04 16:49:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shuaiblue

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ifent at 2013-03-04 16:49:53
grow 不出来没问题啊,你那个水是游离的吧,当然不会grow出来了.......
你的找出来是啥意思,如果只是画图的话,用对称操作就可以显示出来了。

对啊!是游离水,我这是写论文呢,是为了画图,那这个对称操作我该怎么找呢?麻烦告诉我一下,很急!
3楼2013-03-04 21:44:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
shuaiblue: 金币+1 2013-03-05 08:37:03
有一个水分子很正常啊,grow不出来说明你的水分子没有在特殊位置上。 CIF文件给出的是整个unit cell 的contents。
你试试用pack估计就能看到两个水分子了。
学无止境
4楼2013-03-04 22:31:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tzeshyang

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
updayday: 金币+1, 感谢您的热心应助 2013-03-05 01:52:02
shuaiblue: 金币+5 2013-03-05 08:07:51
lst file里有Operators for generating equivalent atoms:
假设:$1   -x, -y+2, -z
在XP里, 键入symm
跳出
1555=......
2555= -x, -y, -z
3555=......
4555=......

算出 -x, -y+2, -z相应的symmetry operator, 这里的是2575, 因为2555= -x, -y, -z;-x, -y, -z 都代表5, 所以-x, -y+2, -z = 2575,

键入sgen 2575应该就ok了。
5楼2013-03-05 00:46:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ifent

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
updayday: 金币+1, 感谢您的热心应助 2013-03-05 01:52:20
shuaiblue: 金币+1 2013-03-05 08:37:09
4楼正解,不过如果不需要画XP图,不需要知道原子对称操作符号,就不用这么麻烦了。
在diamond等画图软件中,用pack模式,把不需要的删掉就可以了。
6楼2013-03-05 01:28:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shuaiblue

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by tzeshyang at 2013-03-05 00:46:52
lst file里有Operators for generating equivalent atoms:
假设:$1   -x, -y+2, -z
在XP里, 键入symm
跳出
1555=......
2555= -x, -y, -z
3555=......
4555=......

算出 -x, -y+2, -z相应的symmetry op ...

嗯!谢谢,我还想问一下一定是$1这个对称操作吗?怎么确定这个是哪个呢?
7楼2013-03-05 08:07:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tzeshyang

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
shuaiblue: 金币+5 2013-03-05 13:55:06
引用回帖:
7楼: Originally posted by shuaiblue at 2013-03-05 08:07:47
嗯!谢谢,我还想问一下一定是$1这个对称操作吗?怎么确定这个是哪个呢?...

如果有多个operators就一个一个试吧。operators应该也不会太多。其中之一的operator才会有你要的effect例如grow。maybe......
8楼2013-03-05 12:43:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shuaiblue

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by tzeshyang at 2013-03-05 12:43:16
如果有多个operators就一个一个试吧。operators应该也不会太多。其中之一的operator才会有你要的effect例如grow。maybe.........

嗯!也就是说这些对称操作都可以使我需要的水分子长出来是吗?
9楼2013-03-05 13:55:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tzeshyang

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
shuaiblue: 金币+3 2013-03-05 15:27:17
引用回帖:
9楼: Originally posted by shuaiblue at 2013-03-05 13:55:00
嗯!也就是说这些对称操作都可以使我需要的水分子长出来是吗?...

是的,试试吧。这个方法比较适合用在plot whole molecule。楼上也说了要看氢键的话, pack可以展示出整体。
10楼2013-03-05 15:08:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shuaiblue 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 302分求调剂 一志愿安徽大学085601 +8 zyx上岸! 2026-04-04 8/400 2026-04-05 23:08 by lbsjt
[考研] 283求调剂 +5 baiiyu 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:35 by 啵啵啵0119
[考研] 322求调剂 +3 嗯哼哼恒 2026-04-05 3/150 2026-04-05 19:52 by nepu_uu
[考研] 301求调剂 +3 XYPLR 2026-04-05 4/200 2026-04-05 19:07 by XYPLR
[考研] 315求调剂 +13 欣喜777 2026-04-04 14/700 2026-04-05 18:48 by liuying2007
[考研] 280求调剂 +4 李rien 2026-04-04 4/200 2026-04-05 18:44 by imissbao
[考研] 296求调剂 +3 汪!?! 2026-04-05 5/250 2026-04-05 17:38 by 蓝云思雨
[考研] 385分 生物学(071000)求调剂 +11 qf626 2026-04-01 11/550 2026-04-05 17:35 by Ecowxq666!
[考研] 288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工 +13 洛神哥哥 2026-04-03 13/650 2026-04-05 17:27 by zzx2138
[考研] 085602调剂 初试总分335 +12 19123253302 2026-04-04 12/600 2026-04-05 08:08 by 544594351
[考研] 本科211 分数293请求调剂 +4 莲菜就是藕吧 2026-04-01 4/200 2026-04-04 22:32 by hemengdong
[论文投稿] 求文献 5+3 ys879651$ 2026-04-02 3/150 2026-04-04 17:22 by bobvan
[考研] 288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工 +39 洛神哥哥 2026-03-31 41/2050 2026-04-03 21:51 by qlm5820
[考研] 286求调剂 +8 lim0922 2026-04-02 8/400 2026-04-03 20:19 by rzh123456
[考研] 085602化工求调剂(331分) +9 111@127 2026-03-30 9/450 2026-04-02 20:00 by dick_runner
[考研] 275学硕081000服从调剂到其他专业,保不住本专业了 +7 一只小小水牛 2026-04-02 8/400 2026-04-02 14:23 by alice-2022
[考研] 282求调剂 +13 呼吸都是减肥 2026-04-01 13/650 2026-04-02 14:10 by baoball
[考研] 一志愿北京科技大学085601材料工程英一数二初试总分335求调剂 +9 双马尾痞老板2 2026-04-01 9/450 2026-04-02 12:14 by oooqiao
[考研] 296求调剂 +4 汪!?! 2026-03-31 7/350 2026-04-01 22:04 by 客尔美德
[考研] 一志愿中海洋320化学工程与技术学硕求调剂 +8 披星河 2026-03-30 8/400 2026-03-31 08:53 by lbsjt
信息提示
请填处理意见