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zmrc

新虫 (初入文坛)

[交流] SSR引物的筛选一定要用PAGE胶么？可不可以用琼脂糖胶？ 已有8人参与

SSR引物的筛选一定要用PAGE胶么？可不可以用琼脂糖胶？
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1楼 2013-03-03 15:32:33
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笑熬酱糊

新虫 (初入文坛)
★
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引用回帖:
7楼: Originally posted by wwwyangjie at 2013-12-10 15:02:19
我最近在筛选合适的SSR引物，用3.5%的琼脂糖胶，跑的时间比较长，到最后条带很模糊。还有就是起初是一个条带，等到两个小时的时候变成两条带，能帮下忙吗，谢谢

我用3%的琼脂糖（110ml胶板），170V电压，1h30min，有点模糊，但能辨认。只是胶太浓不容易打均匀
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9楼2015-01-10 15:38:17
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owen7777

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
page跑出来的更精确吧，个人认为，一般琼脂糖只是用于初次筛选
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2楼2013-03-03 20:48:18
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longyh6411

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
琼脂糖分辨率太低太低了，跑PAGE呗，又不难
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3楼2013-03-03 22:44:56
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游侠892

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
SSR扩增的目标片段一般都很短（大部分都300bp一下），差异也很小，在琼脂糖胶上很难分辨出多态性。
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路漫漫其修远兮，吾将上下而求索
4楼2013-03-04 18:43:34
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