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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » TIP3P 和 SPC/E 适用的体系
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mengsk

金虫 (著名写手)

[交流] TIP3P 和 SPC/E 适用的体系

大家讨论一下 TIP3P 和 SPC/E 两种水分子模型的优缺点吧？以及适用的体系？
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1楼 2013-02-26 16:01:03
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agent99

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★
mengsk(金币+1): 谢谢参与
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-03-03 09:27:50
TIP3P和SPC很像，都是3-site+固定点电荷，无极化作用。SPC/E加了个极化项，虽然只是个常数，但是提高了对水的宏观物性的描述，比如密度。
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3楼2013-02-27 00:01:03
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)
★ ★ ★
mengsk(金币+1): 谢谢参与
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-03-03 09:27:57
这些point charge的模型本质区别都不大，想要精确直接上polarizable model，要是机时无限的话直接ab initio MD.
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4楼2013-02-27 01:26:09
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mengsk

金虫 (著名写手)
是不是TIP3P适合物化体系，SPC/E适合生物体系？？
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7楼2013-04-26 10:48:19
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fhh2626

木虫 (正式写手)
★
mengsk(金币+1): 谢谢参与
实际上没有什么太大的区别，只不过拟合的方式不同罢了

http://en.wikipedia.org/wiki/Water_model
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8楼2013-04-26 22:09:11
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