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0502114073

木虫 (正式写手)

[求助] 请教大家这种构型是怎么建出来的

请教一下，大家看这些图里的构型是怎么建出来的，第一张是优化出来的结构，第二张是初始的简图。比如我想找个复合物计算，初始的构型要怎么建，有没有什么依据，不会是凭空想的吧。

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1楼 2013-02-24 16:57:21
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ter20

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
0502114073: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢哈 2013-02-25 22:16:48
其实这种cluster模型一般是根据经验建模，如果足够仔细，应当穷尽可能的构象做初始结构，然后分别优化，得到的能量最低的结构才是global minimum，当然能量次低的结构也可以视为亚稳态或中间态、过渡态等，根据你的研究角度而定。
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5楼2013-02-25 21:46:15
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
0502114073: 金币+3, ★★★很有帮助, 非常感谢你的帮助，可是初始的模型怎么构建，有什么依据么，比如第一个图里面，他们怎么想到要把Fe 和B F那样放置，不会是凭空猜想的吧。不一样的复合物模型肯定不一样吧？ 2013-02-25 08:51:30
你先建出模型，然后优化得到就可以了
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2楼2013-02-24 21:31:42
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
0502114073: 金币+2, ★有帮助, 我的意思是这样 比如我拿到一种新物质，比如这个Cp2Ru2(CO)4，我最开始建结构有没有什么依据，什么原子要和什么原子链接，键长键角什么的。全部要凭空想出来么？ 2013-02-25 14:49:35
引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-02-24 21:31:42
你先建出模型，然后优化得到就可以了

你可以自己建一个第一幅图试一下，看一下与你想得一样不一样
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3楼2013-02-25 11:30:16
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-02-25 11:30:16
你可以自己建一个第一幅图试一下，看一下与你想得一样不一样...

当然不是凭空想象，你可以仿照类似的化合物去建可能的几种结构，然后优化并选出合适的
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4楼2013-02-25 19:33:44
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