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0502114073

木虫 (正式写手)

[求助] 请教大家这种构型是怎么建出来的

请教一下,大家看这些图里的构型是怎么建出来的,第一张是优化出来的结构,第二张是初始的简图。比如我想找个复合物计算,初始的构型要怎么建,有没有什么依据,不会是凭空想的吧。

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ter20

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
0502114073: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢哈 2013-02-25 22:16:48
其实这种cluster模型一般是根据经验建模,如果足够仔细,应当穷尽可能的构象做初始结构,然后分别优化,得到的能量最低的结构才是global minimum,当然能量次低的结构也可以视为亚稳态或中间态、过渡态等,根据你的研究角度而定。
5楼2013-02-25 21:46:15
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
0502114073: 金币+3, ★★★很有帮助, 非常感谢你的帮助,可是初始的模型怎么构建,有什么依据么,比如第一个图里面,他们怎么想到要把Fe 和B F那样放置,不会是凭空猜想的吧。不一样的复合物模型肯定不一样吧? 2013-02-25 08:51:30
你先建出模型,然后优化得到就可以了
2楼2013-02-24 21:31:42
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
0502114073: 金币+2, 有帮助, 我的意思是这样 比如我拿到一种新物质,比如这个Cp2Ru2(CO)4,我最开始建结构有没有什么依据,什么原子要和什么原子链接,键长键角什么的。全部要凭空想出来么? 2013-02-25 14:49:35
引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-02-24 21:31:42
你先建出模型,然后优化得到就可以了

你可以自己建一个第一幅图试一下,看一下与你想得一样不一样
3楼2013-02-25 11:30:16
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-02-25 11:30:16
你可以自己建一个第一幅图试一下,看一下与你想得一样不一样...

当然不是凭空想象,你可以仿照类似的化合物去建可能的几种结构,然后优化并选出合适的
4楼2013-02-25 19:33:44
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