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0502114073

木虫 (正式写手)

[求助] 请教大家这种构型是怎么建出来的

请教一下,大家看这些图里的构型是怎么建出来的,第一张是优化出来的结构,第二张是初始的简图。比如我想找个复合物计算,初始的构型要怎么建,有没有什么依据,不会是凭空想的吧。

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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
0502114073: 金币+3, ★★★很有帮助, 非常感谢你的帮助,可是初始的模型怎么构建,有什么依据么,比如第一个图里面,他们怎么想到要把Fe 和B F那样放置,不会是凭空猜想的吧。不一样的复合物模型肯定不一样吧? 2013-02-25 08:51:30
你先建出模型,然后优化得到就可以了
2楼2013-02-24 21:31:42
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
0502114073: 金币+2, 有帮助, 我的意思是这样 比如我拿到一种新物质,比如这个Cp2Ru2(CO)4,我最开始建结构有没有什么依据,什么原子要和什么原子链接,键长键角什么的。全部要凭空想出来么? 2013-02-25 14:49:35
引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-02-24 21:31:42
你先建出模型,然后优化得到就可以了

你可以自己建一个第一幅图试一下,看一下与你想得一样不一样
3楼2013-02-25 11:30:16
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-02-25 11:30:16
你可以自己建一个第一幅图试一下,看一下与你想得一样不一样...

当然不是凭空想象,你可以仿照类似的化合物去建可能的几种结构,然后优化并选出合适的
4楼2013-02-25 19:33:44
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ter20

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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0502114073: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢哈 2013-02-25 22:16:48
其实这种cluster模型一般是根据经验建模,如果足够仔细,应当穷尽可能的构象做初始结构,然后分别优化,得到的能量最低的结构才是global minimum,当然能量次低的结构也可以视为亚稳态或中间态、过渡态等,根据你的研究角度而定。
5楼2013-02-25 21:46:15
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wolfzhong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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0502114073: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢哈,我再好好看一下文献 再找一些相关的看看 2013-02-26 14:34:02
楼主给的图我知道是谁做的。呵呵
少核的cluster 在18电子构型的基础上建立,当然可以少于18
其次,这些结构有已合成的或类似物。区别在于L桥连方式不同。你好好看看这个文献
第二张不是初始图,而是简图。chem draw里面画的
6楼2013-02-26 14:11:27
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duzhong

荣誉版主 (文学泰斗)

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0502114073: 金币+5, ★★★很有帮助, 你指的利用什么样的模型?是指类似的物质的 或者经验建模么? 2013-02-26 14:39:54
你可以利用模型尝试你的猜想的,当猜想有些符合的时候可以在优化一下!
7楼2013-02-26 14:30:06
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duzhong

荣誉版主 (文学泰斗)

文献杰出贡献优秀版主优秀版主文献杰出贡献文献杰出贡献文献杰出贡献

根据经验建模的!
8楼2013-02-26 14:43:02
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