24小时热门版块排行榜    

查看: 588  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fcg200808

金虫 (初入文坛)

[求助] 系综平均

请问分子动力学软件中,那个可以模拟体系内能随时间变化,系综平均和升温模拟?具体的步骤是什么呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

奉献才是得到
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿


zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2013-03-03 09:10:58
补充说明几个常用的MD软件:

Amber (不免费)
NAMD(免费)
CHARMM(不免费)
GROMACS(免费)
理论与计算化学,化学物理,生物物理
4楼2013-02-23 08:02:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fcg200808: 金币+3, 有帮助, 还可以 2013-02-23 11:13:33
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-03-03 09:10:40
好像都可以吧。。。
分子动力学得到的是每个原子的位置和速度随时间的变化量,有了这两个值就可以得到体系的所有性质
具体可以参照各个软件的教程,比如NAMD
http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/#namd
2楼2013-02-22 16:27:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fcg200808: 金币+3, 有帮助, 还可以 2013-02-23 11:14:33
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-03-03 09:10:47
都可以的。这都是一些最基本的物理量了。实在不行的话LZ可以自己写程序从输出文件里算
理论与计算化学,化学物理,生物物理
3楼2013-02-23 07:59:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

上面我发的那个网址里面有下载的
6楼2013-02-23 23:55:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 08工学调剂 +11 用户573181 2026-03-20 16/800 2026-03-24 20:36 by :@sbs123
[考研] 300分,材料,求调剂,英一数二 +4 超赞的 2026-03-24 4/200 2026-03-24 20:01 by 了了了了。。
[考研] 调剂 +4 13853210211 2026-03-24 4/200 2026-03-24 19:44 by ms629
[有机交流] 有机合成求助 20+3 FENGSHUJEI 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:31 by 88817753
[考研] 0854 考研调剂 招生了!AI 方向 +5 pk3725069 2026-03-19 17/850 2026-03-24 17:30 by zhouxuan..
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-24 5/250 2026-03-24 15:46 by 星空星月
[材料工程] 一志愿C9材料与化工专业总分300求调剂 +4 曼111 2026-03-24 5/250 2026-03-24 15:44 by 星空星月
[考研] 求调剂一志愿武汉理工大学材料工程(085601) +5 WW.' 2026-03-23 7/350 2026-03-24 14:50 by sprinining
[考研] 321求调剂 +4 Ymlll 2026-03-24 4/200 2026-03-24 14:44 by sprinining
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
[考研] 【双一流院校新能源、环境材料,材料加工与模拟招收大量调剂】 +4 Higraduate 2026-03-22 7/350 2026-03-24 11:23 by 种大树
[考研] 291求调剂 +8 hhhhxn.. 2026-03-23 8/400 2026-03-23 23:15 by peike
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 333求调剂 +6 87639 2026-03-21 10/500 2026-03-23 10:41 by Iveryant
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 324求调剂 +6 lucky呀呀呀鸭 2026-03-20 6/300 2026-03-22 16:01 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 265求调剂 +12 梁梁校校 2026-03-19 14/700 2026-03-21 13:38 by lature00
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
信息提示
请填处理意见