24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1279  |  回复: 11

ada_ada_2002

铁虫 (小有名气)

[求助] 【求助】自动添加氢原子

请教各位:我有一个分子的所有非H元素的x y z 坐标, 请问怎么能自动添加 H 的x y z ? 有什么软件可以做这个么?非常感谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wbulu at 2013-02-23 20:51:05
楼上的大哥能不能详细点说怎么用mercury加氢,学习下,谢谢。

edit里面,edit structure,就会出现一个窗口。

图1 是自动选的,可以直接算出来那里缺氢。(最后一个选项)

图2 是手动添加的,像水分子这里我就用的手动添加。

1.jpg



2.jpg

学无止境
9楼2013-02-25 03:13:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by ada_ada_2002 at 2013-02-23 14:21:15
非常感谢!请问水的H不能加是不是因为位置不确定?...

我以为你不用,所以没加,因为水上面的氢不能自动加,只能手动加。呵呵,给你加上了,见附件。

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : LEEDS1_POWDER_HS-Copy-Copy(3).cif
  • 2013-02-24 04:32:03, 4.38 K

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

学无止境
6楼2013-02-24 04:32:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
mercury就可以, 不会的话,把文件给我发过来,我给你加。
学无止境
2楼2013-02-22 11:28:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ada_ada_2002

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cluster8676 at 2013-02-22 11:28:28
mercury就可以, 不会的话,把文件给我发过来,我给你加。

多谢了!我的Mercury没有license 所以添加H功能不能用

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : LEEDS1_POWDER_HS-Copy-Copy(3).cif
  • 2013-02-22 22:23:42, 4.39 K
3楼2013-02-22 22:24:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ada_ada_2002: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-02-24 03:20:06
见附件,水上面的氢没加。

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : LEEDS1_POWDER_HS-Copy-Copy(3).cif
  • 2013-02-23 09:13:02, 4.2 K
学无止境
4楼2013-02-23 09:13:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ada_ada_2002

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cluster8676 at 2013-02-23 09:13:09
见附件,水上面的氢没加。

非常感谢!请问水的H不能加是不是因为位置不确定?
5楼2013-02-24 03:21:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbulu

至尊木虫 (小有名气)

送鲜花一朵
楼上的大哥能不能详细点说怎么用mercury加氢,学习下,谢谢。
7楼2013-02-24 09:51:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ada_ada_2002

铁虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by cluster8676 at 2013-02-24 04:32:07
我以为你不用,所以没加,因为水上面的氢不能自动加,只能手动加。呵呵,给你加上了,见附件。...

同问   具体是怎么用mercury操作的?
8楼2013-02-24 22:28:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbulu

至尊木虫 (小有名气)

非常感谢,今天学习了,谢谢楼上。
10楼2013-02-25 17:38:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ada_ada_2002 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 投稿求助,期刊 +4 希冀,有书读 2026-05-20 8/400 2026-05-22 10:16 by 希冀,有书读
[基金申请] 今年审到国自然15份,谈谈感受 +25 国自然国社科中 2026-05-17 26/1300 2026-05-22 10:00 by iaeyuan
[考博] 光量子物理方向 博士招生 1人(2026.09) +3 sandyworld 2026-05-15 5/250 2026-05-22 09:30 by sandyworld
[基金申请] 河北省自然科学基金 +5 Peterchao 2026-05-18 5/250 2026-05-21 22:08 by zhang5657
[文学芳草园] 献血感触 +7 呀呀好傻 2026-05-19 13/650 2026-05-21 20:15 by 呀呀好傻
[基金申请] 面上本子正文33页,违规吗?会被低分嘛? +14 1234567wang 2026-05-17 16/800 2026-05-21 17:58 by 脆脆的饼干
[基金申请] 国自然评分 +4 无名者登山 2026-05-20 5/250 2026-05-21 16:35 by swuq
[基金申请] 国自然上会要求 +7 无名者登山 2026-05-18 11/550 2026-05-21 15:50 by draco1987
[基金申请] 提交了我也来说说感想 +9 fummck 2026-05-20 10/500 2026-05-21 14:17 by draco1987
[基金申请] 评审有感 +15 popular289 2026-05-18 26/1300 2026-05-21 10:35 by 西葫芦炒鸡蛋
[论文投稿] Sci. Bull. 悲剧经验 +7 jyang1999 2026-05-16 8/400 2026-05-21 08:50 by 能丫
[论文投稿] 投MDPI的三个期刊都被桌拒 +3 木虫研究牲 2026-05-17 4/200 2026-05-21 08:02 by bobvan
[考博] 云南大学材料与能源学院解琳课题组钙钛矿博士招生 +4 光伏爱好者 2026-05-17 6/300 2026-05-21 01:37 by 17520222914
[有机交流] 反应很差,大量原料没有反应 5+3 Mr.Zot 2026-05-19 8/400 2026-05-20 22:19 by Equinoxhua
[考博] 如果工作了想读博,可以边工作边读全日制嘛? 30+3 铁达火车 2026-05-18 5/250 2026-05-20 09:33 by tfang
[教师之家] 上海大学实验技术岗位非升即走 +12 嘻嘻哈哈乐呵呵 2026-05-15 13/650 2026-05-20 08:34 by xli1984
[考博] 26/27申博自荐-锂/钠电池方向 5+3 狗头军师. 2026-05-15 4/200 2026-05-19 09:10 by moonboat
[考博] 博士申请 +5 星…… 2026-05-18 6/300 2026-05-18 23:49 by 糊糊涂涂好
[硕博家园] 我在等一个没有答案的答案 +3 Love_MH 2026-05-17 3/150 2026-05-18 02:22 by 竹林孤影
[硕博家园] 申请博士 +3 呃?呃 2026-05-15 3/150 2026-05-16 11:01 by a4742549
信息提示
请填处理意见