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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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ada_ada_2002

铁虫 (小有名气)

[求助] 【求助】自动添加氢原子

请教各位:我有一个分子的所有非H元素的x y z 坐标, 请问怎么能自动添加 H 的x y z ? 有什么软件可以做这个么?非常感谢!
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wbulu at 2013-02-23 20:51:05
楼上的大哥能不能详细点说怎么用mercury加氢,学习下,谢谢。

edit里面,edit structure,就会出现一个窗口。

图1 是自动选的,可以直接算出来那里缺氢。(最后一个选项)

图2 是手动添加的,像水分子这里我就用的手动添加。

1.jpg



2.jpg

学无止境
9楼2013-02-25 03:13:14
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by ada_ada_2002 at 2013-02-23 14:21:15
非常感谢!请问水的H不能加是不是因为位置不确定?...

我以为你不用,所以没加,因为水上面的氢不能自动加,只能手动加。呵呵,给你加上了,见附件。

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  • 2013-02-24 04:32:03, 4.38 K

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学无止境
6楼2013-02-24 04:32:07
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普通回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
mercury就可以, 不会的话,把文件给我发过来,我给你加。
学无止境
2楼2013-02-22 11:28:28
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ada_ada_2002

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cluster8676 at 2013-02-22 11:28:28
mercury就可以, 不会的话,把文件给我发过来,我给你加。

多谢了!我的Mercury没有license 所以添加H功能不能用

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  • 2013-02-22 22:23:42, 4.39 K
3楼2013-02-22 22:24:26
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ada_ada_2002: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-02-24 03:20:06
见附件,水上面的氢没加。

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  • 2013-02-23 09:13:02, 4.2 K
学无止境
4楼2013-02-23 09:13:09
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ada_ada_2002

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cluster8676 at 2013-02-23 09:13:09
见附件,水上面的氢没加。

非常感谢!请问水的H不能加是不是因为位置不确定?
5楼2013-02-24 03:21:15
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wbulu

至尊木虫 (小有名气)

送鲜花一朵
楼上的大哥能不能详细点说怎么用mercury加氢,学习下,谢谢。
7楼2013-02-24 09:51:05
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ada_ada_2002

铁虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by cluster8676 at 2013-02-24 04:32:07
我以为你不用,所以没加,因为水上面的氢不能自动加,只能手动加。呵呵,给你加上了,见附件。...

同问   具体是怎么用mercury操作的?
8楼2013-02-24 22:28:04
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wbulu

至尊木虫 (小有名气)

非常感谢,今天学习了,谢谢楼上。
10楼2013-02-25 17:38:46
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