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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 有没有根据pdb结构计算酶的活性空腔体积的软件
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qbin1304

新虫 (正式写手)

[求助] 有没有根据pdb结构计算酶的活性空腔体积的软件

有没有根据pdb结构计算酶的活性空腔体积的软件，给推荐个。
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1楼 2013-02-20 14:07:45
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

上网搜索下Castp,可以粗略的计算空腔体积
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3楼2013-02-23 19:46:02
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lilin_sensor

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
qbin1304: 金币+1, ★有帮助 2013-02-21 17:40:49
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2013-02-23 19:45:15
有PDB号码的酶，基本都可以找到active site空腔的体积，如果你要算，我个人认为应该计算腔内最短距离间球体体积，毕竟放小分子进去不是注水。
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Sensor/pointing/changes
2楼2013-02-21 12:17:20
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