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qbin1304

新虫 (正式写手)

[求助] 有没有根据pdb结构计算酶的活性空腔体积的软件

有没有根据pdb结构计算酶的活性空腔体积的软件,给推荐个。
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

上网搜索下Castp,可以粗略的计算空腔体积
3楼2013-02-23 19:46:02
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lilin_sensor

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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qbin1304: 金币+1, 有帮助 2013-02-21 17:40:49
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2013-02-23 19:45:15
有PDB号码的酶,基本都可以找到active site空腔的体积,如果你要算,我个人认为应该计算腔内最短距离间球体体积,毕竟放小分子进去不是注水。
Sensor/pointing/changes
2楼2013-02-21 12:17:20
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