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026li

金虫 (小有名气)

[求助] 分析成键类型

如图所示,甲醇与主体分子作用的ESP图,如何分析两个分子间作用成键,或是离子键,或是共价键,氢键的类型?

分析.jpg
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026li

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by sobereva at 2013-02-17 18:00:56
这种复合物的静电势图什么问题也说明不了。显然也不可能是共价键。
约化密度梯度分析是最合适的,比AIM直观,见《使用Multiwfn图形化研究弱相互作用》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/bb1162d881b8d5ee3cc2cb ...

非常感谢,还有一个问题请教,如图Si和Al原子的断键用H饱和,但是H和环形结构中的O的距离约在2.5A左右,会有一定程度氢键作用,对整体计算甲醇与环形结构的结合能是否影响较大?这个问题,通过什么方法计算得以验证?请您给些意见
5楼2013-02-18 09:07:20
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夏天的娃

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
026li: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-02-17 08:55:37
cenwanglai: 金币+1, 新年好~ 2013-02-17 09:23:26
做AIM可以分析试试共价键,氢键的呢。。。
LZ可以在AIM板块关注一下哦。
2楼2013-02-16 21:27:17
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026li

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 夏天的娃 at 2013-02-16 21:27:17
做AIM可以分析试试共价键,氢键的呢。。。
LZ可以在AIM板块关注一下哦。

非常感谢
3楼2013-02-17 08:56:03
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
026li: 金币+7, ★★★很有帮助 2013-02-18 09:03:47
这种复合物的静电势图什么问题也说明不了。显然也不可能是共价键。
约化密度梯度分析是最合适的,比AIM直观,见《使用Multiwfn图形化研究弱相互作用》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/bb1162d881b8d5ee3cc2cbdc
也可以绘制单体静电势图,并做分子表面分析,分析单体间的静电势如何互补,见
《使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/6601fff28c4fd9d643c36acc

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4楼2013-02-17 18:00:56
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