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分析成键类型
如图所示,甲醇与主体分子作用的ESP图,如何分析两个分子间作用成键,或是离子键,或是共价键,氢键的类型?
分析.jpg
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2013-02-14 00:33:52
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夏天的娃
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2013-02-17 08:55:37
cenwanglai: 金币+1, 新年好~
2013-02-17 09:23:26
做AIM可以分析试试共价键,氢键的呢。。。
LZ可以在AIM板块关注一下哦。
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2楼
2013-02-16 21:27:17
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专业: 无机合成和制备化学
引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
夏天的娃
at 2013-02-16 21:27:17
做AIM可以分析试试共价键,氢键的呢。。。
LZ可以在AIM板块关注一下哦。
非常感谢
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3楼
2013-02-17 08:56:03
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sobereva
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2013-02-18 09:03:47
这种复合物的静电势图什么问题也说明不了。显然也不可能是共价键。
约化密度梯度分析是最合适的,比AIM直观,见《使用Multiwfn图形化研究弱相互作用》(
http://hi.baidu.com/sobereva/item/bb1162d881b8d5ee3cc2cbdc
)
也可以绘制单体静电势图,并做分子表面分析,分析单体间的静电势如何互补,见
《使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用》(
http://hi.baidu.com/sobereva/item/6601fff28c4fd9d643c36acc
)
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2013-02-17 18:00:56
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4楼
:
Originally posted by
sobereva
at 2013-02-17 18:00:56
这种复合物的静电势图什么问题也说明不了。显然也不可能是共价键。
约化密度梯度分析是最合适的,比AIM直观,见《使用Multiwfn图形化研究弱相互作用》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/bb1162d881b8d5ee3cc2cb ...
非常感谢,还有一个问题请教,如图Si和Al原子的断键用H饱和,但是H和环形结构中的O的距离约在2.5A左右,会有一定程度氢键作用,对整体计算甲醇与环形结构的结合能是否影响较大?这个问题,通过什么方法计算得以验证?请您给些意见
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5楼
2013-02-18 09:07:20
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