应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » Arlequin 3.11 用过这个软件请进，求指导~~~
101/1返回列表
查看: 3145  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

公子_小白

新虫 (初入文坛)

[求助] Arlequin 3.11 用过这个软件请进，求指导~~~

我想用这个软件中的AMOVA计算遗传变异在群体内和群体间的分布，可是实在不会用，连数据都不知道怎么导入软件，求大神指点迷津~~~~~~
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2013-02-04 21:58:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lufuhao

木虫 (著名写手)

极品木虫

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-06 17:15:12
1.你是什么标记
2.群体分层是否已经完成？

用Convert （http://heidi.chnebu.ch/soku.php?id=convert) 转换成Arlequin输入格式，然后你就可以google看怎么操作了

PopGenTransformer (http://code.google.com/p/popgentransformer/)是我很久前写的格式转化perl脚本。可惜没能支持Arlequin，但对于很多其他程序如popgen， powermarker， structure等还算好用
赞一下 回复此楼
将心比心
2楼2013-02-04 23:16:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

公子_小白

新虫 (初入文坛)
我已经用DnaSP转成arp格式了，但是导进去之后不能进行AMOVA运算，蛋疼死了。。。
有没有其他软件可以计算遗传变异分布和遗传分化系数啊~~~~
赞一下 回复此楼
3楼2013-02-05 13:16:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

公子_小白

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lufuhao at 2013-02-04 23:16:19
1.你是什么标记
2.群体分层是否已经完成？

用Convert （http://heidi.chnebu.ch/soku.php?id=convert) 转换成Arlequin输入格式，然后你就可以google看怎么操作了

PopGenTransformer (http://code.google.com ...

我做COI序列分析
群体分层怎么分啊
赞一下 回复此楼
4楼2013-03-06 13:27:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lufuhao

木虫 (著名写手)

极品木虫

【答案】应助回帖

现在普遍用的Structure （http://pritch.bsd.uchicago.edu/software.html）作为关联作图中的群体分层软件，当然还有其他的一些好的软件
赞一下 回复此楼
将心比心
5楼2013-03-12 19:47:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maoxiaomiao

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 公子_小白 at 2013-02-05 13:16:18
我已经用DnaSP转成arp格式了，但是导进去之后不能进行AMOVA运算，蛋疼死了。。。
有没有其他软件可以计算遗传变异分布和遗传分化系数啊~~~~

你好，好像用DNASP转换的格式只能计算FST值，计算amova好像不行 请问楼主现在会群体分层了么，求赐教~
赞一下 回复此楼
6楼2013-05-22 16:50:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虫虫aini

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by maoxiaomiao at 2013-05-22 16:50:51
你好，好像用DNASP转换的格式只能计算FST值，计算amova好像不行 请问楼主现在会群体分层了么，求赐教~...

顶起来，求楼主赐教群体分层
赞一下 回复此楼
7楼2013-05-30 15:45:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

523069653

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lufuhao at 2013-02-04 23:16:19
1.你是什么标记
2.群体分层是否已经完成？

用Convert （http://heidi.chnebu.ch/soku.php?id=convert) 转换成Arlequin输入格式，然后你就可以google看怎么操作了

PopGenTransformer (http://code.google.com ...

亲，请问下 DNAsp 怎么转化成ARP格式啊  感谢
赞一下 回复此楼
8楼2014-01-08 16:37:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dolphinlin

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 公子_小白 at 2013-02-05 13:16:18
我已经用DnaSP转成arp格式了，但是导进去之后不能进行AMOVA运算，蛋疼死了。。。
有没有其他软件可以计算遗传变异分布和遗传分化系数啊~~~~

请问用DnaSP将序列文件转换成arp格式的路径是怎样的呢？我在DNAsp里边的File-Save/export data As-Arlequin保存，得到的文件是.hap格式的，怎么都弄不出.arp格式的文件来
赞一下 回复此楼
9楼2015-02-06 11:27:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wl19920830

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 公子_小白 at 2013-02-05 13:16:18
我已经用DnaSP转成arp格式了，但是导进去之后不能进行AMOVA运算，蛋疼死了。。。
有没有其他软件可以计算遗传变异分布和遗传分化系数啊~~~~

您好，您会用amova进行分析了吗
赞一下 回复此楼
10楼2018-05-26 13:54:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 公子_小白 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 7/350 2026-11-01 02:33 by YXM1FDCSE8Bn
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 5/250 2026-11-01 02:28 by YXM1FDCSE8Bn
[考博] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 5/250 2026-11-01 02:25 by YXM1FDCSE8Bn
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 5/250 2026-11-01 02:25 by YXM1FDCSE8Bn
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 12/600 2026-11-01 02:19 by YXM1FDCSE8Bn
[博后之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 14/700 2026-11-01 02:06 by YXM1FDCSE8Bn
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 02:02 by YXM1FDCSE8Bn
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 00:48 by YXM1FDCSE8Bn
[找工作] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 5/250 2026-11-01 00:44 by YXM1FDCSE8Bn
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 4/200 2026-11-01 00:41 by YXM1FDCSE8Bn
[基金申请] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 19/950 2026-11-01 00:17 by YXM1FDCSE8Bn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 12/600 2026-11-01 00:15 by YXM1FDCSE8Bn
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 19/950 2026-10-31 22:44 by YXM1FDCSE8Bn
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 24/1200 2026-10-31 22:39 by YXM1FDCSE8Bn
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 9/450 2026-10-31 21:34 by YXM1FDCSE8Bn
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 13/650 2026-10-31 17:12 by hKe7U1kad5Sg
[考博] 2027博士申请-临床检验诊断学、病原生物学、微生物方向 50+3 yyh@ 2026-10-28 4/200 2026-10-31 12:47 by 可淡不可忘
[硕博家园] 越来越担心硕士毕业后没有竞争力了 +8 zuesli 2026-10-27 14/700 2026-10-30 22:44 by 好运连连公主
[基金申请] 论文的挂名怎么评判贡献？基金申请中，排名第一的挂名文章 +3 biily 2026-10-25 3/150 2026-10-30 18:33 by 旁观2020
[硕博家园] 申博自荐 2篇一区TOP+1篇EI+2公开发明专利 2027博士申请 +3 小小阿光 2026-10-27 3/150 2026-10-29 23:56 by 起风了的快乐
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭