24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2859  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

公子_小白

新虫 (初入文坛)

[求助] Arlequin 3.11 用过这个软件请进,求指导~~~

我想用这个软件中的AMOVA计算遗传变异在群体内和群体间的分布,可是实在不会用,连数据都不知道怎么导入软件,求大神指点迷津~~~~~~
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maoxiaomiao

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 公子_小白 at 2013-02-05 13:16:18
我已经用DnaSP转成arp格式了,但是导进去之后不能进行AMOVA运算,蛋疼死了。。。
有没有其他软件可以计算遗传变异分布和遗传分化系数啊~~~~

你好,好像用DNASP转换的格式只能计算FST值,计算amova好像不行 请问楼主现在会群体分层了么,求赐教~
6楼2013-05-22 16:50:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

lufuhao

木虫 (著名写手)

极品木虫

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-06 17:15:12
1.你是什么标记
2.群体分层是否已经完成?

用Convert (http://heidi.chnebu.ch/soku.php?id=convert) 转换成Arlequin输入格式,然后你就可以google看怎么操作了

PopGenTransformer (http://code.google.com/p/popgentransformer/)是我很久前写的格式转化perl脚本。可惜没能支持Arlequin,但对于很多其他程序如popgen, powermarker, structure等还算好用
将心比心
2楼2013-02-04 23:16:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

公子_小白

新虫 (初入文坛)

我已经用DnaSP转成arp格式了,但是导进去之后不能进行AMOVA运算,蛋疼死了。。。
有没有其他软件可以计算遗传变异分布和遗传分化系数啊~~~~
3楼2013-02-05 13:16:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

公子_小白

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lufuhao at 2013-02-04 23:16:19
1.你是什么标记
2.群体分层是否已经完成?

用Convert (http://heidi.chnebu.ch/soku.php?id=convert) 转换成Arlequin输入格式,然后你就可以google看怎么操作了

PopGenTransformer (http://code.google.com ...

我做COI序列分析
群体分层怎么分啊
4楼2013-03-06 13:27:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 291求调剂 +7 关忆北. 2026-04-14 7/350 2026-04-16 01:30 by L0alice
[考研] 300求调剂 +8 橙a777 2026-04-15 8/400 2026-04-16 01:25 by L0alice
[考研] 急需调剂 +5 绝不放弃22 2026-04-15 5/250 2026-04-15 23:11 by Tide man
[考研] 271求调剂 +32 2261744733 2026-04-11 33/1650 2026-04-15 22:03 by noqvsozv
[考研] 调剂求收留 +34 果然有我 2026-04-10 35/1750 2026-04-15 13:05 by 西北望—风沙
[考研] 复试调剂 +21 积极向上; 2026-04-10 23/1150 2026-04-15 12:50 by 西北望—风沙
[考研] 335求调剂 +19 想上岸呀!! 2026-04-12 21/1050 2026-04-14 16:23 by Art1977
[考研] 一志愿沪9,326求生物学调剂 +10 刘墨墨 2026-04-13 10/500 2026-04-14 15:16 by zs92450
[考研] 求调剂 +20 MAX怅惘 2026-04-09 22/1100 2026-04-14 14:57 by 独醉梦孤城
[考研] 农学0904 312求调剂 +4 Say Never 2026-04-11 4/200 2026-04-14 09:10 by zs92450
[考研] 考研英一数一338分 +9 长江大学东校区 2026-04-13 10/500 2026-04-14 00:41 by 王珺璞
[考研] B区0809 ,数一英一,290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
[考研] 一志愿211 0703化学 346分求调剂 +26 土豆er? 2026-04-09 29/1450 2026-04-13 15:15 by 独醉梦孤城
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[考研] 一志愿浙大生物325分求调剂 +9 zysheng 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:31 by yuyin1233
[考研] 调剂 +6 青灯不负 2026-04-09 6/300 2026-04-11 20:35 by dongdian1
[考研] 283求调剂 086004考英二数二 +17 那个噜子 2026-04-10 18/900 2026-04-11 16:27 by 明月此时有
[考研] 296求调剂 +6 汪!?! 2026-04-09 6/300 2026-04-11 11:25 by zhq0425
[考研] 一志愿京区985,085401电子信息,本科电子信息 +3 阳光开朗的男孩 2026-04-10 3/150 2026-04-10 16:29 by sophia_93
[考研] 一志愿沪9,326生物学求相关专业调剂 +4 刘墨墨 2026-04-09 4/200 2026-04-10 12:07 by pengliang8036
信息提示
请填处理意见