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公子_小白

新虫 (初入文坛)

[求助] Arlequin 3.11 用过这个软件请进,求指导~~~

我想用这个软件中的AMOVA计算遗传变异在群体内和群体间的分布,可是实在不会用,连数据都不知道怎么导入软件,求大神指点迷津~~~~~~
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maoxiaomiao

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 公子_小白 at 2013-02-05 13:16:18
我已经用DnaSP转成arp格式了,但是导进去之后不能进行AMOVA运算,蛋疼死了。。。
有没有其他软件可以计算遗传变异分布和遗传分化系数啊~~~~

你好,好像用DNASP转换的格式只能计算FST值,计算amova好像不行 请问楼主现在会群体分层了么,求赐教~
6楼2013-05-22 16:50:51
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lufuhao

木虫 (著名写手)

极品木虫

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-06 17:15:12
1.你是什么标记
2.群体分层是否已经完成?

用Convert (http://heidi.chnebu.ch/soku.php?id=convert) 转换成Arlequin输入格式,然后你就可以google看怎么操作了

PopGenTransformer (http://code.google.com/p/popgentransformer/)是我很久前写的格式转化perl脚本。可惜没能支持Arlequin,但对于很多其他程序如popgen, powermarker, structure等还算好用
将心比心
2楼2013-02-04 23:16:19
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公子_小白

新虫 (初入文坛)

我已经用DnaSP转成arp格式了,但是导进去之后不能进行AMOVA运算,蛋疼死了。。。
有没有其他软件可以计算遗传变异分布和遗传分化系数啊~~~~
3楼2013-02-05 13:16:18
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公子_小白

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lufuhao at 2013-02-04 23:16:19
1.你是什么标记
2.群体分层是否已经完成?

用Convert (http://heidi.chnebu.ch/soku.php?id=convert) 转换成Arlequin输入格式,然后你就可以google看怎么操作了

PopGenTransformer (http://code.google.com ...

我做COI序列分析
群体分层怎么分啊
4楼2013-03-06 13:27:42
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