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zoeye

金虫 (小有名气)

[求助] 看不懂这个,麻烦懂测序的达人帮忙解释下,谢谢

结果为
The flowchart of sequence preprocessing, quality control and chimera detection

不知道从左往右推是什么逻辑啊?
意义是什么?
一篇对我比较重要的文献上看到的
但是偶不懂测序 这个结果偶不懂呢

测序.jpg
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niil

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小丹木木: 金币+5, MolEPI+1, 卧虎藏龙啊 2013-03-06 17:16:33
zoeye: 金币+2 2013-04-16 09:07:35
这该是对测序结果的处理。测序的每个反应得到一个reads(读长)。
第一个:测序获得原始PE reads数量。
第二个:去掉了没有N的reads的数量,N是没有测出的碱基。
第三个:进一步通过片段重叠处理PE reads,获得了更长一点的序列的数量。
第四个:去掉标签、接头和引物的序列之后的序列(V6 tag)的数量。
第五个:通过质量分析,获得高质量的V6 tags。具体指标可能还要参照文中描述。
第六个:最后得到的 非嵌合的V6 tags的数量。也是需要相应的方法分析的。
Stop fighting,let it flow.
2楼2013-03-06 13:19:13
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