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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 如何使dump文件中既包含原子信息也包含健信息？？？？？？
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匿名

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1楼 2013-01-26 11:54:08
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xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhihaikou at 2013-01-27 13:50:11
lammps能直接输出pdb文件不？...

lammps是否能直接输出pdb不清楚，gromacs是可以的
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6楼2013-01-27 19:09:57
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhihaikou: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢在帮助看看 2013-01-26 15:55:35
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-01-26 18:24:03
如果是polymer，键的信息是要你输入的，程序无法改变。 如果是用tersoff，airebo之类的，是否成键由原子间距决定，同力场有关， dump也是无法输出的。
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2楼2013-01-26 15:26:05
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匿名

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3楼2013-01-26 15:56:46
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xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhihaikou: 金币+3, ★★★很有帮助, 3Q。在帮忙看看 2013-01-27 13:49:54
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-01-28 09:06:22
输出为pdb文件包含键连信息
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4楼2013-01-26 18:46:57
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