24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1468  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

Leliel

铜虫 (初入文坛)

[求助] 在苯甲酸体系中计算Pka所用的方法基组选择 已有1人参与

各位高手,我只是一个小小的本科生,在一个本科生项目组里做一些计算机辅助的计算,但是非常遗憾的是我对量化基本一无所知(我是学药学的=。=)
简单的来说,现在的任务是要用gaussian03来对一系列对取代的苯甲酸来算Pka,通过阅读文献与gaussian的一些基本manual,我大体了解了一些皮毛。
在我的计算过程中,我在b3lyp/6-31+g*水平下进行Opt的优化和Freq的计算
在b3lyp/6-311++G**的水平下进行PCM,溶剂化效应。但是最后得到的苯甲酸的Pka居然在9左右,这个偏差也未免太大了点??

在保持优化水平不变的基础上,我对PCM的计算做过一些调整,方法换过HF,MP2,基组也换过6-31+G*,但是结果也没有什么变化...我是非常无语,由于自己知识所限,根本不知道选择什么更优的方法和基组,还希望各位高手给与帮助!如果有需要的话我可以贴上自己的输入文件!!

先谢过!!
回复此楼
God‘s in his heaven,all's right with the world。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Leliel

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chembetsey at 2013-01-21 23:18:21
pKa很难算的,而且计算过程没你想得那么简单,查查文献就知道了
重点是你计算的溶剂化能不好

是啊,我查了不少文献,基本就是通篇讲用了很多种method和basic sets的组合...还有各种溶剂化模型= =所以说搞的我现在很头大...我是直接从液相里算,直接找的是PCM里面的Total free energy也就是液相里的G,当然这里面应该也有溶剂化能的一部分吧,误差会很大...所以在寻找更好的基组
God‘s in his heaven,all's right with the world。
3楼2013-01-22 16:18:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2013-01-22 20:48:58
pKa很难算的,而且计算过程没你想得那么简单,查查文献就知道了
重点是你计算的溶剂化能不好
2楼2013-01-21 23:18:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

基组只是问题的一个方面而已,甚至不是最重要的方面,你直接用能使用的最大基组就可以了
方法和溶剂化模型才是影响最大的
还有就是计算溶剂化能的方法,也有很多种
4楼2013-01-22 22:21:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

basinlotus

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以参考这篇文章,附件里有输入文件的模版。
J. Phys. Chem. A, 2018, 122 (17), pp 4366–4374
DOI: 10.1021/acs.jpca.8b01751
5楼2018-11-02 23:59:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085410 273求调剂 +10 X1999 2026-04-09 10/500 2026-04-12 09:24 by 逆水乘风
[考研] 267求调剂 +8 再忙也要吃饭啊 2026-04-09 8/400 2026-04-11 21:42 by cfdbai
[考研] 283求调剂 086004考英二数二 +17 那个噜子 2026-04-10 18/900 2026-04-11 16:27 by 明月此时有
[考研] 求调剂 +3 胃痉挛累了 2026-04-11 5/250 2026-04-11 14:13 by luhong1990
[考研] 346,工科求调剂 +3 moser233 2026-04-09 3/150 2026-04-11 10:04 by zhq0425
[考研] 22408调剂求助 +7 毂12 2026-04-09 9/450 2026-04-11 09:23 by 哦哦123
[考研] 22408 366分,本科211,一志愿西工大 +4 Rubt 2026-04-09 4/200 2026-04-10 19:51 by chemisry
[考研] 301求调剂 +5 149. 2026-04-10 5/250 2026-04-10 15:45 by 柴小白
[考研] 085404,285分求调剂 +12 薇薇考研 2026-04-07 14/700 2026-04-09 23:10 by parmtree
[考研] 材料化工总分334求调剂 +16 Riot2025 2026-04-08 17/850 2026-04-09 20:19 by maddjdld
[考研] 086000生物与医药调剂 +7 awwwwwooooo 2026-04-09 7/350 2026-04-09 13:31 by 北极159263
[考研] 353求调剂 +8 晴空万里air 2026-04-07 8/400 2026-04-09 00:18 by GouQ
[考研] 266调剂 +8 daya sun 2026-04-07 9/450 2026-04-08 20:27 by yutian743
[考研] 材料工程专业日语生求调剂 +9 111623 2026-04-07 9/450 2026-04-07 23:31 by 一只好果子?
[考研] 331求调剂 +5 张元一 2026-04-07 6/300 2026-04-07 22:13 by hemengdong
[考研] 316求调剂 +4 15318418673 2026-04-07 4/200 2026-04-07 22:12 by hemengdong
[考研] 信工所11408 340分 本科西安交大自动化 +3 moontrek 2026-04-06 3/150 2026-04-07 09:56 by chongya
[考研] 338求调剂 +4 我想上岸ii 2026-04-05 4/200 2026-04-06 21:04 by 木子君1218
[考研] 一志愿河北工业大学材料工程,初试344求专硕调剂 +6 15933906766 2026-04-05 6/300 2026-04-06 13:21 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +10 chenxrlkx 2026-04-05 10/500 2026-04-06 11:31 by 猪会飞
信息提示
请填处理意见