24小时热门版块排行榜    

查看: 1448  |  回复: 4

Leliel

铜虫 (初入文坛)

[求助] 在苯甲酸体系中计算Pka所用的方法基组选择 已有1人参与

各位高手,我只是一个小小的本科生,在一个本科生项目组里做一些计算机辅助的计算,但是非常遗憾的是我对量化基本一无所知(我是学药学的=。=)
简单的来说,现在的任务是要用gaussian03来对一系列对取代的苯甲酸来算Pka,通过阅读文献与gaussian的一些基本manual,我大体了解了一些皮毛。
在我的计算过程中,我在b3lyp/6-31+g*水平下进行Opt的优化和Freq的计算
在b3lyp/6-311++G**的水平下进行PCM,溶剂化效应。但是最后得到的苯甲酸的Pka居然在9左右,这个偏差也未免太大了点??

在保持优化水平不变的基础上,我对PCM的计算做过一些调整,方法换过HF,MP2,基组也换过6-31+G*,但是结果也没有什么变化...我是非常无语,由于自己知识所限,根本不知道选择什么更优的方法和基组,还希望各位高手给与帮助!如果有需要的话我可以贴上自己的输入文件!!

先谢过!!
回复此楼
God‘s in his heaven,all's right with the world。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2013-01-22 20:48:58
pKa很难算的,而且计算过程没你想得那么简单,查查文献就知道了
重点是你计算的溶剂化能不好
2楼2013-01-21 23:18:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Leliel

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chembetsey at 2013-01-21 23:18:21
pKa很难算的,而且计算过程没你想得那么简单,查查文献就知道了
重点是你计算的溶剂化能不好

是啊,我查了不少文献,基本就是通篇讲用了很多种method和basic sets的组合...还有各种溶剂化模型= =所以说搞的我现在很头大...我是直接从液相里算,直接找的是PCM里面的Total free energy也就是液相里的G,当然这里面应该也有溶剂化能的一部分吧,误差会很大...所以在寻找更好的基组
God‘s in his heaven,all's right with the world。
3楼2013-01-22 16:18:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

基组只是问题的一个方面而已,甚至不是最重要的方面,你直接用能使用的最大基组就可以了
方法和溶剂化模型才是影响最大的
还有就是计算溶剂化能的方法,也有很多种
4楼2013-01-22 22:21:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

basinlotus

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以参考这篇文章,附件里有输入文件的模版。
J. Phys. Chem. A, 2018, 122 (17), pp 4366–4374
DOI: 10.1021/acs.jpca.8b01751
5楼2018-11-02 23:59:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Leliel 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +6 纸鱼ly 2026-03-21 6/300 2026-03-23 12:08 by Iveryant
[考研] 材料与化工考研调剂 +3 孅華 2026-03-22 3/150 2026-03-23 11:20 by barlinike
[考研] 333求调剂 +6 87639 2026-03-21 10/500 2026-03-23 10:41 by Iveryant
[考研] 求调剂材料学硕080500,总分289分 5+3 @taotao 2026-03-19 21/1050 2026-03-23 10:17 by 冠c哥
[考研] 085600材料与化工 +10 安全上岸! 2026-03-16 10/500 2026-03-23 09:31 by Jy?
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 材料工程专硕 348分求调剂 +3 冬辞. 2026-03-17 5/250 2026-03-21 18:47 by 学员8dgXkO
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[基金申请] 学校已经提交到NSFC,还能修改吗? 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 求调剂 +6 Mqqqqqq 2026-03-19 6/300 2026-03-21 08:04 by JourneyLucky
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +4 一志愿京区211 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:41 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南昌大学,327分,材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 350求调剂 +5 weudhdk 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:04 by luoyongfeng
[论文投稿] 申请回稿延期一个月,编辑同意了。但系统上的时间没变,给编辑又写邮件了,没回复 10+3 wangf9518 2026-03-17 4/200 2026-03-19 23:55 by babero
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
信息提示
请填处理意见