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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 在苯甲酸体系中计算Pka所用的方法基组选择
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Leliel

铜虫 (初入文坛)

[求助] 在苯甲酸体系中计算Pka所用的方法基组选择 已有1人参与

各位高手，我只是一个小小的本科生，在一个本科生项目组里做一些计算机辅助的计算，但是非常遗憾的是我对量化基本一无所知（我是学药学的=。=）
简单的来说，现在的任务是要用gaussian03来对一系列对取代的苯甲酸来算Pka，通过阅读文献与gaussian的一些基本manual，我大体了解了一些皮毛。
在我的计算过程中，我在b3lyp/6-31+g*水平下进行Opt的优化和Freq的计算
在b3lyp/6-311++G**的水平下进行PCM，溶剂化效应。但是最后得到的苯甲酸的Pka居然在9左右，这个偏差也未免太大了点？？

在保持优化水平不变的基础上，我对PCM的计算做过一些调整，方法换过HF，MP2，基组也换过6-31+G*，但是结果也没有什么变化...我是非常无语，由于自己知识所限，根本不知道选择什么更优的方法和基组，还希望各位高手给与帮助！如果有需要的话我可以贴上自己的输入文件！！

先谢过！！
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1楼 2013-01-21 15:14:21
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chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2013-01-22 20:48:58
pKa很难算的，而且计算过程没你想得那么简单，查查文献就知道了
重点是你计算的溶剂化能不好
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2楼2013-01-21 23:18:21
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Leliel

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chembetsey at 2013-01-21 23:18:21
pKa很难算的，而且计算过程没你想得那么简单，查查文献就知道了
重点是你计算的溶剂化能不好

是啊，我查了不少文献，基本就是通篇讲用了很多种method和basic sets的组合...还有各种溶剂化模型= =所以说搞的我现在很头大...我是直接从液相里算，直接找的是PCM里面的Total free energy也就是液相里的G，当然这里面应该也有溶剂化能的一部分吧，误差会很大...所以在寻找更好的基组
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3楼2013-01-22 16:18:46
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chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

基组只是问题的一个方面而已，甚至不是最重要的方面，你直接用能使用的最大基组就可以了
方法和溶剂化模型才是影响最大的
还有就是计算溶剂化能的方法，也有很多种
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4楼2013-01-22 22:21:12
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basinlotus

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以参考这篇文章，附件里有输入文件的模版。
J. Phys. Chem. A, 2018, 122 (17), pp 4366–4374
DOI: 10.1021/acs.jpca.8b01751
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5楼2018-11-02 23:59:09
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