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Gaussian输出文件中键长和Gaussian View中键长不一样是什么原因?
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用gaussian 03做了一个OPT优化,在优化收敛之后,出现结构参数如下: Optimization completed. -- Stationary point found. ---------------------------- ! Optimized Parameters ! ! (Angstroms and Degrees) ! -------------------------- -------------------------- ! Name Definition Value Derivative Info. ! -------------------------------------------------------------------------------- ! R1 R(1,3) 2.4507 -DE/DX = 0.0 ! ! R2 R(1,7) 2.0577 -DE/DX = 0.0 ! ! R3 R(1,10) 2.0577 -DE/DX = 0.0 ! ! R4 R(1,61) 2.0577 -DE/DX = 0.0 ! ! R5 R(1,64) 2.0577 -DE/DX = 0.0 ! .…… ! A1 A(3,1,7) 88.0775 -DE/DX = 0.0 ! ! A2 A(3,1,10) 88.0775 -DE/DX = 0.0 ! ! A3 A(3,1,61) 88.0775 -DE/DX = 0.0 ! ! A4 A(3,1,64) 88.0775 -DE/DX = 0.0 ! ! A5 A(7,1,10) 89.9353 -DE/DX = 0.0 ! ! A6 A(7,1,64) 89.9356 -DE/DX = 0.0 ! …… ! D1 D(7,1,3,6) 15.0978 -DE/DX = 0.0 ! ! D2 D(7,1,3,9) -74.9021 -DE/DX = 0.0 ! ! D3 D(7,1,3,60) -164.9023 -DE/DX = 0.0 ! ! D4 D(7,1,3,63) 105.0979 -DE/DX = 0.0 ! 上面三段分别代表键长、键角、二面角,但是这些数据和在g View中看到的不同: 比如:R(1.3)的value=2.4507 , 而在Gview中打开结果文件1号原子和3号原子键长为:2.450699, 键角和二面角都存在类似问题。 1、造成两者不同的原因是什么? 2、如果Optimized Parameters下面的数据不可靠,那有没有什么方法可以从gview中同时快速的提取多个键长数据? |
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