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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于ChIP染色质免疫沉淀技术的疑惑
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晶晶虫

金虫 (小有名气)

[求助] 关于ChIP染色质免疫沉淀技术的疑惑

最近在研究DNA和蛋白质相互作用的ChIP技术，实验室内和周围实验室都没有人做过，有个问题：我看文章上基本上的实验步骤是用甲醛完成DNA和protein在动植物体内的交联，之后提取染色质，在超声破碎后用所要研究的蛋白质的特异性抗体做免疫沉淀，DNA-protein复合物提取出来之后再解交联，然后DNA拿去测序或者microarray.

看文献中的方法都是做的体内实验，有没有可能我直接提取植物DNA，然后加上我的自己在E,coli中表达纯化的重组蛋白体外交联，然后利用我重组蛋白上的His-tag的抗体直接免疫沉淀DNA和蛋白复合物，或者用NI柱纯化呢？？？
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1楼 2013-01-10 01:41:22
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zhang881007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
晶晶虫: 金币+3 2013-01-10 23:54:24
如果你要试试的话，我建议你用无细胞翻译体系，而不是Ecoli.否则你的实验假象太大，发布了好文章。
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shine
3楼2013-01-10 10:48:35
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
晶晶虫: 金币+5 2013-01-10 23:54:17
crosslinking可以做in vitro实验。不过体外实验的假象多。
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2楼2013-01-10 07:10:40
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晶晶虫

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-10 07:10:40
crosslinking可以做in vitro实验。不过体外实验的假象多。

恩呵, 你知道有人这样做过么，有没有参考文献呢哇？
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4楼2013-01-10 16:55:35
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
晶晶虫: 金币+2 2013-01-14 17:13:31
引用回帖:
4楼: Originally posted by 晶晶虫 at 2013-01-10 16:55:35
恩呵, 你知道有人这样做过么，有没有参考文献呢哇？...

有人这么做的。不过都是结合一些特定的体内实验来补充验证interaction的。我自己不做这个，见到有些文献里有说到，没仔细研究过这个方法。
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5楼2013-01-11 08:36:09
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