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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 基于配体的虚拟筛选
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wl507586

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amber

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1楼2013-01-05 11:06:55
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chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-01-05 19:38:22
加氢、加电荷！如果你是做参照，不需要做能量优化，如果是对接，建议优化一下。
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wl507586
2楼2013-01-05 14:11:50
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3楼2013-01-05 21:07:15
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1、诱导对接？你用的什么软件？

2、高通量筛选，你指的是实验？ 一般的对接软件做10w化合物对接 还是比较快的。
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5楼2013-01-07 12:03:48
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6楼2013-01-08 23:32:42
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jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-01-11 08:44:20
1、诱导对接 薛定谔可以做。但比较慢，不适合大量的分子去做！

2、薛定谔的glide有虚拟筛选的参数，标准对接 10w分子呵呵 还需要等待较长时间。不推荐这样做。
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7楼2013-01-09 09:10:55
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