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WAX2010

银虫 (小有名气)

[交流] 我可能发现了一种新奇的生物发光现象已有19人参与

实验过程中发现了一个新奇的发光现象,想研究一下却不知从何入手,希望各位前辈为我指点迷津。
我是细胞生物学专业的一名学生,平日主要从事细菌展示技术的研究,所用的细菌是大肠杆菌MC1061,内部有一个可诱导表达GFP和CM抗性的表达载体。实验过程中需要对细菌离心和清洗,我一般采用3000g,5min离心,离心后会把上清的LB倒到一个小废液缸里,清洗用的PBS也会倒入这个废液缸,偶尔少量的菌液也会倒入此废液缸,由于实验比较忙,废液缸里的废液并非天天处理,有时候我看到里面浑浊或者表面漂了一层微生物,我都会加入新吉尔灭或者75%的酒精灭菌。前段时间有一次,我加入酒精后摇了摇,发现本来微黄的液体变成了蓝绿色,我感觉很新奇但也没太在意,就把废液处理掉了,并把废液缸用清水涮了涮。接下来一次废液中加了一点75%酒精后又出现了一样的现象。一开始我想是不是里面污染了其他的细菌或真菌,便把废液吸出来,3000g,5min离心,可见有白色的细菌离下来,但上清依然是蓝色的,我把蓝色的上清放到紫外灯下,可以看到有很亮的蓝白色荧光,而离心下来的细菌,PBS重悬后却看不到荧光,即使将我们诱导GFP表达的菌PBS重悬后在紫外灯下也是看不到荧光的。我想上清有蛋白?我又把上清10000g,5min离心,并没有看到有任何东西离心下来。因此上清中是不是产生了一种新的发光物质。我对这个现象很感兴趣,因此把废液收集了起来。放置了一夜后蓝绿色又变成了浅黄色,振荡摇动液体,液体慢慢从浅黄色变成浅蓝色又变成蓝绿色(以上现象可能说明变成蓝色液体与酒精无关),而且随着放置时间的延长,里面长起来的菌越来越多,摇动液体使其由黄色变成蓝绿色花的时间也越来越长,这是不是说明里面某种物质在有氧存在的情况下可以发出蓝光?但是我离心收集的上清放在EP管中一直是浅蓝色的呀,颜色的变化也不一定依赖氧的存在,还是二氧化碳的存在抑制了蓝绿色的显现。上网查到有发光细菌,我看到的现象与发光细菌不同,发光细菌是在黑暗中看到光,而我观察到的是在可见光下有蓝绿色,紫外激发下也可产生荧光。
我也试图从这个废液中挑出感兴趣的菌,我先取出少量废液,加入到含有CM的LB中,发现菌长的很慢,而且长起来后,怎么摇动也没有看到变色的现象,放在紫外灯下也没看到有很强的荧光。
我又取了一点废液到无CM的LB中,菌长的还可以,就是也没看到变色现象?
下一步该怎么办呢??
希望大家多多指点,谢谢

[ Last edited by WAX2010 on 2013-1-3 at 14:30 ]

谢谢大家的建议,由于老板反对进行尝试研究,菌种已被处理了……

[ Last edited by WAX2010 on 2013-10-8 at 14:42 ]
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化学污染与环境健康 考研经验 只是感兴趣 细菌表面展示

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大手牵小手
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WAX2010

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
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2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-03 16:26:24
现象非常有意思。你确定发光的是菌本身吗?从你的描述感觉是photoreceptor。很多生物都有的,只是含量有限。我感觉还是和你倒在里面的工程菌和其上清直接相关的。我不知道为什么你的菌在紫外下没有荧光。我做的荧光 ...

1. 发光的应该不是菌,因为3000g,5min离心后,荧光并没有减弱很多,但也有一点点变弱,减弱不知是不是因为菌的折射造成光强改变。
2. GFP最佳激发应该在488nm左右,是不是紫外激发不合适
3. 因为不是做这个方面的,不知如何纯化鉴定呢,老板或许也不愿在这方面投钱吧
谢谢指点
大手牵小手
10楼2013-01-04 20:12:39
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银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
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3楼: Originally posted by huihui37 at 2013-01-03 20:40:31
我是做发光细菌方向的。我是用4000g离心15min得到菌体的。我培养的菌体放入密闭环境中,有微弱的光,但是震荡后颜色会加深。白天基本看不到荧光,放在暗处荧光会比较强的。看你的推断是不是化学物质引起的?你可以加 ...

我看到的是菌液震荡后从黄色变成了蓝绿色,应该不是加深的缘故,放到暗处也没有看到有荧光,离心后上清依然有荧光,所以推测是不是菌产生了什么物质
大手牵小手
11楼2013-01-04 20:15:59
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银虫 (小有名气)

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4楼: Originally posted by zhaodahe at 2013-01-03 21:29:10
我觉得你观察到的现象非常有趣,很有可能是某种会分泌到培养液中的物质(可能是蛋白质,或者化学物质),而非微生物;3000g是可以离心下大部分细菌的,而10000g并不能离去蛋白质;既然能观察到较强的光,说明这种物 ...

1.我也推测是分泌到培养基里的一些物质,可是不知如何分离鉴定呢,因为我们课题组不做这方面的研究,老板或许不愿意花钱在这上面,有没有一些简单易行的纯化方面(勿笑,菜鸟,嘿嘿)
2.我看了一下,振荡之后肉眼可见的颜色变化似乎对荧光并没有太大的影响,或许是肉眼判断不准
3.我重新接种了一点,养了一天一夜后,菌摇起来了,振荡是可以是菌液变色的,因此可以断定与乙醇无关
谢谢指点
大手牵小手
12楼2013-01-04 20:22:27
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5楼: Originally posted by 雨轩36 at 2013-01-03 23:50:22
祝贺楼主!^_^)Y发现问题是成功之母啊,就再多做几次实验,把实验细节控制好、分析好,对其他可能引起颜色反应的因素逐个排除,抓住核心因素。现在只是发现这个问题存在,接下来去弄清楚如何存在需要更加细致与耐心 ...

谢谢您的鼓励,也愿您实验顺利开心
大手牵小手
13楼2013-01-04 20:23:25
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银虫 (小有名气)

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6楼: Originally posted by toya at 2013-01-04 00:10:31
海里的有些生物会发光,你看看life of pi

嗯,看过了,很漂亮
大手牵小手
14楼2013-01-04 20:23:42
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银虫 (小有名气)

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7楼: Originally posted by 克隆大虾 at 2013-01-04 00:19:25
有可能是合成的化合物。和培养基 培养条件有关..

我推测也可能是合成的某种物质
大手牵小手
15楼2013-01-04 20:24:16
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WAX2010

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
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8楼: Originally posted by tmoonday at 2013-01-04 00:35:51
加酒精和不加酒精是否有区别?取少量废液加入LB摇,检测时有没有加酒精。有条件做个HPLC,看看是什么物质

我取了少量废液在LB中摇了一天一夜,不加酒精振荡也可以看到变色,说明与酒精无关,条件有限,可能做不了HPLC,不知还有没有更简单点的分离方法
谢谢指点
大手牵小手
16楼2013-01-04 20:26:10
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银虫 (小有名气)

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9楼: Originally posted by 明亮奥义 at 2013-01-04 17:25:18
我!支持你,有细心和好奇心,一定会很成功的

多谢多谢
大手牵小手
17楼2013-01-04 20:28:41
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银虫 (小有名气)

引用回帖:
18楼: Originally posted by zhaodahe at 2013-01-04 20:46:13
我的意思是,你认为的发光现象,是否真的是发光,而不是某种物质的颜色变化;在黑暗中看一下是否发光就清楚了。我估计是蛋白质,而这样的物质一般都是用液相分离的,然后做进一步的鉴定。如果没有相关仪器,可以自 ...

我看了一下,黑暗中不发光,看来我说是生物发光是不正确的,多谢多谢
大手牵小手
19楼2013-01-04 21:01:30
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