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death_snake

金虫 (初入文坛)

[求助] 求教:如何修改力场参数

我用antechamber生成了一个dmf的小分子嘛,然后每次导入leap都要先导入frcmod以及mol2才可以使用,觉得好麻烦。
想问问大家,有没什么办法可以把DMF的参数直接写入amber的力场参数里面,以后读力场的时候就可以直接读出来。
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death_snake

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xuxm03 at 2013-01-02 08:18:37
例如 在 $your_ambertools_path/dat/leap/cmd下的leaprc.gaff文件中添加
loadoff dmf.lib
loadamberparams dmf.frcmod

其中将dmf.lib复制到 $your_ambertools_path/dat/leap/lib文件夹下
将dmf.frcmod复制到 ...

谢谢哇。已试验可行
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6楼2013-01-04 13:01:53
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songyunlong

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-30 19:57:01
death_snake: 金币+10, 有帮助 2013-01-01 15:57:23
death_snake: 金币+30 2013-01-04 13:02:20
建成lib文件,加到片段库里就可以啦 。
为了人类美好的明天!!
2楼2012-12-30 17:00:10
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death_snake

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by songyunlong at 2012-12-30 17:00:10
建成lib文件,加到片段库里就可以啦 。

那个,可以说得详细一点么。。就是lib文件该怎么生成呢。。。
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3楼2012-12-31 09:03:35
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songyunlong

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by death_snake at 2012-12-31 09:03:35
那个,可以说得详细一点么。。就是lib文件该怎么生成呢。。。...

http://ambermd.org/tutorials/basic/tutorial4b/
为了人类美好的明天!!
4楼2012-12-31 12:26:04
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