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death_snake金虫 (初入文坛)
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求教：如何修改力场参数
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我用antechamber生成了一个dmf的小分子嘛，然后每次导入leap都要先导入frcmod以及mol2才可以使用，觉得好麻烦。 想问问大家，有没什么办法可以把DMF的参数直接写入amber的力场参数里面，以后读力场的时候就可以直接读出来。   |
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death_snake
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例如 在 $your_ambertools_path/dat/leap/cmd下的leaprc.gaff文件中添加 loadoff dmf.lib loadamberparams dmf.frcmod 其中将dmf.lib复制到 $your_ambertools_path/dat/leap/lib文件夹下 将dmf.frcmod复制到 $your_ambertools_path/dat/leap/parm文件夹下 然后每次你在tleap中leaprc.gaff的时候就会自动导入力场参数了 |
5楼2013-01-02 08:18:37