24小时热门版块排行榜    

查看: 1423  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lchunmei001

木虫 (正式写手)

[求助] read_restart非周期性边界条件

请教大家,我想先对模拟的含非周期性边界(s s p)的体系弛豫后利用该结果(restart)进行进一步的模拟,但发现restart貌似不能存储关于模拟体系的边界条件,我在利用restart文件进行进一步模拟时,就老出错,提示我的命令(如deform)不能用于周期性边界条件,请问这种情况怎么办?如果再次加入边界条件的话又会提示让加入lattice等信息,这样明显就不对了,请问大家这种情况该怎么处理?

[ Last edited by lchunmei001 on 2012-12-29 at 16:07 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lchunmei001

木虫 (正式写手)

楼上能否具体一些,已经转成data文件了,但不知道怎么加入非周期边界条件?data文件如下:
LAMMPS data file from restart file: timestep = 10000, procs = 1

4140 atoms

1 atom types

1.7643589196984124e+00 6.8364067338083956e+01 xlo xhi
0.0000000000000000e+00 2.8779245994292481e+01 ylo yhi
0.0000000000000000e+00 3.3231410843758454e+01 zlo zhi

Masses

1 58.69

Atoms

1 1 2.3180795497795548e+00 2.7804986077682554e+00 2.2132490999663856e+00 -512 -512 -512
5 1 4.4786939123806073e+00 1.3074796094784296e+00 1.4553209760089412e+00 -512 -512 -512
54 1 6.7517995267437350e+00 2.8543446596840343e+00 2.1924282346059987e+00 -512 -512 -512
3楼2012-12-29 21:44:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-01-01 13:59:57
lchunmei001: 金币+5, 有帮助 2013-01-13 09:14:15
把restart转成data文件,然后自己修正。
2楼2012-12-29 17:16:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-01-01 14:00:12
lchunmei001: 金币+15, 有帮助 2013-01-13 09:14:27
引用回帖:
3楼: Originally posted by lchunmei001 at 2012-12-29 21:44:26
楼上能否具体一些,已经转成data文件了,但不知道怎么加入非周期边界条件?data文件如下:
LAMMPS data file from restart file: timestep = 10000, procs = 1

4140 atoms

1 atom types

1.76435891969841 ...

非周期边界条件需要在你的输入文件里设置, 然后从data文件里读入周界数据。 另外,有些指令对边界条件有特别要求。
若还有疑问, 贴出你的输入文件和错误信息。。
4楼2012-12-30 14:08:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lchunmei001

木虫 (正式写手)

谢谢大家关注,谢谢ddll_slsl,是可以重新加入命令就是。非常感谢。
5楼2013-01-13 11:29:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 生物学一志愿985,分数349求调剂 +4 zxts12 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:20 by ilovexiaobin
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 考研化学学硕调剂,一志愿985 +5 张vvvv 2026-03-15 7/350 2026-03-21 19:23 by ColorlessPI
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +14 曦熙兮 2026-03-15 14/700 2026-03-21 19:12 by ColorlessPI
[基金申请] 山东省面上项目限额评审 +3 石瑞0426 2026-03-19 3/150 2026-03-21 18:59 by RRRKKK
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 316求调剂 +6 梁茜雯 2026-03-19 6/300 2026-03-21 06:32 by Ecowxq666!
[考研] 初始318分求调剂(有工作经验) +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大,求调剂 +5 材化逐梦人 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:26 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +4 葵梓卫队 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:02 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武理材料工程348求调剂 +3  ̄^ ̄゜汗 2026-03-19 4/200 2026-03-20 21:01 by zhukairuo
[考研] 261求B区调剂,科研经历丰富 +3 牛奶很忙 2026-03-20 4/200 2026-03-20 19:34 by JourneyLucky
[考研] 招收调剂硕士 +4 lidianxing 2026-03-19 12/600 2026-03-20 12:25 by lidianxing
[考研] 0703化学调剂 +4 18889395102 2026-03-18 4/200 2026-03-19 16:13 by 30660438
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
信息提示
请填处理意见