24小时热门版块排行榜    

查看: 1646  |  回复: 3

dajin

铁虫 (小有名气)

[求助] LAMP法靶序列怎么找回!!! 已有1人参与

LAMP(环介导等温扩增)法中,我要扩增基因的靶序列找不到了,现在只有引物的序列。因需要设计环引物,所以必须需要靶序列。
能有什么方法通过引物序列来找回基因的靶序列或靶序列的基因名称吗?请大家帮帮忙,非常感谢。引物是通过http://primerexplorer.jp/e/index.html这个在线软件设计的。
OMP:  ID:35     dimer(minimum)dG=-2.13  
  label 5'pos 3'pos len Tm 5'dG 3'dG GCrate Sequence
  F3 187 206 20 60.75 -5.25 -5.50 0.55 ACCAGAACTACGGTCAGTGG
  B3 392 410 19 59.22 -4.36 -4.90 0.53 GTCTTCAGCAACGGTGTCT
  FIP   38     GCGCAGCCTGCAGATTGAAG-GTCTGGGGTGGTGCAAAG
  BIP   40     GGCAAGACCGCAGTTACCGC-TTGGTGTAGGAAACTTCCGG
回复此楼
在压力中能享受生活吗
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

暴力曹

银虫 (初入文坛)

能咨询一下关于LAMP的信息不~
无心亦心 自在观真
2楼2013-11-04 21:21:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangyunjing

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-08-28 21:49:39
采用ncbi primer blast一般都能搜到对应引物的靶序列
rainwater
3楼2014-08-28 16:34:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

酱油歪楼党

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangyunjing at 2014-08-28 16:34:59
采用ncbi primer blast一般都能搜到对应引物的靶序列

不用这么复杂,直接把F3-B3放进NCBI做个Blast就完事了
如果出来种类很多,再把FIP大致拆分成F2、F1c,BIP也类似拆分,放F3-B3之间进行比对就完事了
4楼2014-08-29 09:03:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dajin 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +4 gdd2018 2026-08-28 9/450 2026-08-28 14:22 by jklily
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+5) +12 晴天加油 2026-08-26 13/650 2026-08-28 11:32 by skyjudy
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见