| 查看: 1434 | 回复: 9 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
Gwax07金虫 (小有名气)
Sir
|
[求助]
呼叫gromacs大神
|
||
|
Sample Text想问问使用make_ndx命令分组的问题,我不需要定义哪些具体的原子为一个组,而是想把体系中距某个中心原子一定半径以内的所有原子定义成一个组,之外的定义成另一个组(随着系统的动力学演化,半径之内的原子可能跑到外面去,外面的也可能跑进来,所以无法按照具体的原子序号来定义组),请问各位这样定义组的方式在gromacs里面能实现吗? 另外本人想做qm/mm计算,目前已经成功地将mopac编译进gromacs中,但是我看手册上的说明,似乎基组只能用到6-311系列,那么其它的呢?比如说过渡金属常用的lanl2dz以及其赝势能否使用呢? 望各位不吝赐教,谢谢. [ Last edited by Gwax07 on 2012-12-25 at 18:35 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Gromacs |
» 猜你喜欢
实名举报：华南理工大学物理与光电学院副院长李志远婚内两次出轨女学生（博士）
已经有6人回复
-
现代”学阀”该如何界定
已经有5人回复
-
我的奶奶
已经有3人回复
-
各位大神，目前国内有哪些比较好用的逆合成软件？
已经有10人回复
-
申博发邮件
已经有10人回复
-
国社科系统bug了，是不是要放榜了？
已经有9人回复
-
上海工程技术大学激光智能制造课题组｜2027级博士研究生招生公告
已经有8人回复
-
上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生
已经有8人回复
Gwax07
金虫 (小有名气)
Sir
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 787.7
- 帖子: 161
- 在线: 139.2小时
- 虫号: 439135
- 注册: 2007-10-08
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
9楼2012-12-26 13:20:18
chembetsey
木虫 (小有名气)
- 应助: 125 (高中生)
- 金币: 3820.1
- 散金: 5
- 红花: 9
- 帖子: 262
- 在线: 281.8小时
- 虫号: 1781694
- 注册: 2012-04-27
- 专业: 理论和计算化学
2楼2012-12-26 01:17:31
zhoufeng1982
木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2431.1
- 散金: 1
- 红花: 3
- 帖子: 2691
- 在线: 82.6小时
- 虫号: 1193591
- 注册: 2011-01-21
- 专业: 物理化学
3楼2012-12-26 08:33:53
Gwax07
金虫 (小有名气)
Sir
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 787.7
- 帖子: 161
- 在线: 139.2小时
- 虫号: 439135
- 注册: 2007-10-08
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
4楼2012-12-26 09:14:04