24小时热门版块排行榜    

查看: 900  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wl507586

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小旭823

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wl507586 at 2012-12-25 19:26:08
好的,谢谢,我还想问一下,如果两个相同的分子,一个是离子的形式,一个是完整分子,在pp里应该不算是duplicate molecules把?...

你需要三個component
完整流程如下:
SD reader -> remove duplicate molecules -> SD writer
這樣就會去掉所有重複的molecules

另外你問的一個是離子, 一個是完整分子的問題
不算同一個, 因為remove duplicate molecules 會先將molecules 轉換成canonical SMILE format, 再進行比對
當然, 三維構形旋轉角度不一樣都算是一個, 但是變成離子, 轉換後的計算就會判斷成另一個
也就不會去掉了

不知道這樣是否有回答道你的問題!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2012-12-28 01:01:29
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

lrf1980

新虫 (小有名气)

怎么会生成很多构象呢?一般不是生成能量最小构象么?不然的话,也没有什么意义啊。
2楼2012-12-24 21:07:10
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小旭823

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-12-25 08:43:10
wl507586: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-12-27 15:11:28
使用remove duplicate molecules這個component就行了
3楼2012-12-25 00:13:57
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wl507586

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

4楼2012-12-25 18:31:08
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 上海电力大学材料防护与新材料重点实验室招收调剂研究生(材料、化学、电化学,环境) +4 我爱学电池 2026-03-23 4/200 2026-03-25 00:59 by 1027_324
[考研] 求调剂323材料与化工 +3 1124361 2026-03-24 3/150 2026-03-24 20:24 by peike
[考研] 0854人工智能方向招收调剂 +3 章小鱼567 2026-03-24 3/150 2026-03-24 19:46 by zhouxuan..
[考研] 085602 289分求调剂 +5 WWW西西弗斯 2026-03-24 5/250 2026-03-24 18:51 by jhhcooi
[考研] 招08考数学 +7 laoshidan 2026-03-20 16/800 2026-03-24 17:52 by 乌拉儿山脉
[考研] 0854 考研调剂 招生了!AI 方向 +5 pk3725069 2026-03-19 17/850 2026-03-24 17:30 by zhouxuan..
[考研] 材料学硕,求调剂 6+3 糖葫芦888ll 2026-03-22 7/350 2026-03-24 17:11 by hello七七
[考研] 一志愿南航材料专317分求调剂 +5 炸呀炸呀炸薯条 2026-03-23 5/250 2026-03-24 16:52 by 星空星月
[考博] 申博26年 +4 八6八68 2026-03-19 4/200 2026-03-24 15:49 by 小Ben呵呵
[考研] 291求调剂 +8 hhhhxn.. 2026-03-23 8/400 2026-03-23 23:15 by peike
[考研] 335分 | 材料与化工专硕 | GPA 4.07 | 有科研经历 +4 cccchenso 2026-03-23 4/200 2026-03-23 23:00 by 徐ckkk
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 考研调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 南昌大学材料专硕311分求调剂 +6 77chaselx 2026-03-20 6/300 2026-03-21 07:24 by JourneyLucky
[考研] 294求调剂材料与化工专硕 +15 陌の森林 2026-03-18 15/750 2026-03-20 23:28 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +11 Ymlll 2026-03-18 15/750 2026-03-20 19:40 by 丁丁*
信息提示
请填处理意见