24小时热门版块排行榜    

查看: 893  |  回复: 7

wl507586

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lrf1980

新虫 (小有名气)

怎么会生成很多构象呢?一般不是生成能量最小构象么?不然的话,也没有什么意义啊。
2楼2012-12-24 21:07:10
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小旭823

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-12-25 08:43:10
wl507586: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-12-27 15:11:28
使用remove duplicate molecules這個component就行了
3楼2012-12-25 00:13:57
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wl507586

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

4楼2012-12-25 18:31:08
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wl507586

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

5楼2012-12-25 19:26:08
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

费佳

铁虫 (初入文坛)

版主,您好,请问一下您的pipeline是在哪下的啊?能否发给我一份或者告诉我一下下载地址啊?不甚感激。邮箱yiying405051766@126.com
6楼2012-12-26 09:24:53
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小旭823

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wl507586 at 2012-12-25 19:26:08
好的,谢谢,我还想问一下,如果两个相同的分子,一个是离子的形式,一个是完整分子,在pp里应该不算是duplicate molecules把?...

你需要三個component
完整流程如下:
SD reader -> remove duplicate molecules -> SD writer
這樣就會去掉所有重複的molecules

另外你問的一個是離子, 一個是完整分子的問題
不算同一個, 因為remove duplicate molecules 會先將molecules 轉換成canonical SMILE format, 再進行比對
當然, 三維構形旋轉角度不一樣都算是一個, 但是變成離子, 轉換後的計算就會判斷成另一個
也就不會去掉了

不知道這樣是否有回答道你的問題!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2012-12-28 01:01:29
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wl507586

禁虫 (小有名气)

送鲜花一朵
本帖内容被屏蔽

8楼2012-12-28 23:11:10
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wl507586 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600材料与化工调剂 +8 A-哆啦Z梦 2026-03-23 13/650 2026-03-24 21:05 by greychen00
[考研] 生物学学硕求调剂 +6 小羊睡着了? 2026-03-23 9/450 2026-03-24 20:21 by 小羊睡着了?
[考研] 0854电子信息求调剂 +6 α____ 2026-03-22 7/350 2026-03-24 19:46 by sunjie8888
[考研] 招08考数学 +7 laoshidan 2026-03-20 16/800 2026-03-24 17:52 by 乌拉儿山脉
[考研] 材料学硕,求调剂 6+3 糖葫芦888ll 2026-03-22 7/350 2026-03-24 17:11 by hello七七
[考研] 277分求调剂,跨调材料 +3 考研调剂lxh 2026-03-24 3/150 2026-03-24 13:52 by JourneyLucky
[考研] 一志愿哈工大,085400,320,求调剂 +3 gdlf9999 2026-03-24 3/150 2026-03-24 10:08 by 搏击518
[考研] 求调剂 +7 十三加油 2026-03-21 7/350 2026-03-23 23:48 by 热情沙漠
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
[考研] 生物学调剂 +5 Surekei 2026-03-21 5/250 2026-03-22 14:39 by tcx007
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[基金申请] 学校已经提交到NSFC,还能修改吗? 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 321求调剂 +9 何润采123 2026-03-18 11/550 2026-03-20 23:19 by JourneyLucky
[考研] 一志愿苏州大学材料求调剂,总分315(英一) +5 sbdksD 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:10 by luoyongfeng
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +11 Ymlll 2026-03-18 15/750 2026-03-20 19:40 by 丁丁*
信息提示
请填处理意见