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summer2771

木虫 (正式写手)

[求助] 请问WB的数据在论文中应该怎样给出才算标准?

请教大家一个问题,大家做通路时,最后成文的时候一般是怎样来反映数据?我是说总量和磷酸化的是分开给出?还是直接以一个磷酸化/总量的形式来给出呢?谢谢!
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summer2771

木虫 (正式写手)

今天在另一个论坛上看到一个坛友说,一般都只用磷酸化/总量的形式来比较,但是这个磷酸化并不是磷酸化值/内参,总量也不是总量/内参。而直接是咱们用软件所读出的磷酸化蛋白的IOD值,和蛋白总量的IOD值。
难道我一直以来都是把错误当成了真理?我一直都认为是给出来的P/T值应该是
(P/内参)/(T/内参)
如果两个蛋白是同一版胶来跑的,直接用P/T是没问题,但是如果不是同一版胶,这样肯定就是不对的吧!?
21楼2012-12-25 00:26:03
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ankang0910

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励交流! 2012-12-22 19:12:36
summer2771: 金币+1, ★有帮助, 感谢回帖发表宝贵意见! 2012-12-22 20:58:58
分开给图,一个总蛋白条带,一个相对应的磷酸化的条带。分析灰度值可以写出磷酸化/总量的ratio来。
实验顺利!!
2楼2012-12-22 15:42:59
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蓝天_1988

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
summer2771: 金币+1, ★有帮助, 谢谢您的热心回帖! 2012-12-22 22:01:12
补充下楼上的,应该在加一个内参。
3楼2012-12-22 21:30:20
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summer2771

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 蓝天_1988 at 2012-12-22 21:30:20
补充下楼上的,应该在加一个内参。

不过,这样岂不是要求一定要P和TOTAL同一版胶来跑!?否则只能是用各自的内参?要是只拿其中一个内参来用的话,似乎有不严谨之嫌?
但是我们在实际操作中,往往都不是P和TOTAL一起跑的...
4楼2012-12-22 22:02:59
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