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summer2771

木虫 (正式写手)

应助: 1 (幼儿园)
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专业: 细胞信号转导

[求助] 请问WB的数据在论文中应该怎样给出才算标准？

请教大家一个问题，大家做通路时，最后成文的时候一般是怎样来反映数据？我是说总量和磷酸化的是分开给出？还是直接以一个磷酸化/总量的形式来给出呢？谢谢！

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1楼 2012-12-22 10:49:25

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

porphybaby

金虫 (正式写手)

应助: 89 (初中生)
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性别: GG
专业: 化学生物学与生物有机化学

【答案】应助回帖

引用回帖:

18楼: Originally posted by summer2771 at 2012-12-24 06:52:27
感谢您的真诚分享！建议版主给这位战友加分！我送上一朵鲜花聊表敬意。主要是因为觉得这位战友敢于坦白自己试验所存在的问题。放眼WB红遍中国，每个人在文章中贴出来的条带或是柱形图都是强弱明显、误差线几乎不存 ...

就是说我加了我的药物处理过细胞之后
它会比control 的有变化。从条带上就能看出，随着我药物的浓度增大，某些基因上调的幅度会越来越大，那就是趋势是上调。从条带就可以看出越来越深。

上调下调的比例是指，我每个都会计算灰度。跟各自的内参相比较，然后以control自己的那个(目的基因/看家基因)的值为参考，用其他组的去除以它，得出一系列数值，那么就会是 control为1，其他的为1.5啊，2.7啊，3.3啊之类的。

但同一个药物浓度，我做了3次，它那个相对值并不稳定。例如，

control    2 uM  4 uM  6 uM
1          1.3    1.5    1.8
1          2.5    4.2    5.2
1          1.8    3.8    4.7
比如这样它每次的趋势都是对的但是单独计算各自的就没法做到误差范围内。如果说我要用3次平均，来计算我的药物对某基因的影响程度我就觉得这样似乎不太靠谱咯。。。只能说有影响是激活它表达而不能具体到增强了多少。