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gromacs 相关函数计算 autocorrelation function
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gromacs计算二面角的自相关函数 autocorrelation function 命令如下: g_angle -f traj.trr -n dihedral.ndx -type dihedral -b 0 -e 5000 -oc dihcorr.xvg 为什么输出只到2500 ps,也就是2.5 ns?我试过不加-b -e参数,还是只到2500,到不了5000。请高手指点,谢谢! 还想请问二面角的cross-correlation function应该怎样计算?请写下详细的命令和参数,不胜感激! |
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