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羽曦云泽

新虫 (初入文坛)

[求助] grompp出错

Fatal error:
Atoms in the .top are not numbered consecutively from 1 (rather, atomnr = 1, while at->nr = 33)

想问下如何可以快速的找到top文件中序列所断的地方,大家有什么好办法吗?
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justinhenry

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-12-18 11:11:11
我没有遇到过这种情况,但是从error看来,是因为你的top文件
#include XXXXXXX
#include XXXXXXX
的顺序和。GRO文件中的顺序不一致
你试试把两个文件中的顺序调整一下,弄一致了就好
The only limit is the limit you set on yourself
2楼2012-12-18 10:56:50
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明月照清渠

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-12-19 08:20:00
把序号改成1就行了~

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2012-12-18 23:04:53
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娇桥

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 明月照清渠 at 2012-12-18 23:04:53
把序号改成1就行了~

你好,我也出现了相同的问题,你说的把序号改成1 是什么意思啊?我不太懂,能详细的解释一下么?比如我有两个输入的小分子的itp 文件,我是要把两个的原子序号都改成1 么?
4楼2017-12-27 17:02:06
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