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羽曦云泽

新虫 (初入文坛)

[求助] grompp出错

Fatal error:
Atoms in the .top are not numbered consecutively from 1 (rather, atomnr = 1, while at->nr = 33)

想问下如何可以快速的找到top文件中序列所断的地方，大家有什么好办法吗？
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1楼 2012-12-18 10:02:34
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justinhenry

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-12-18 11:11:11
我没有遇到过这种情况，但是从error看来，是因为你的top文件
#include XXXXXXX
#include XXXXXXX
的顺序和。GRO文件中的顺序不一致
你试试把两个文件中的顺序调整一下，弄一致了就好
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The only limit is the limit you set on yourself
2楼2012-12-18 10:56:50
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明月照清渠

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-12-19 08:20:00
把序号改成1就行了~
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

娇桥
3楼2012-12-18 23:04:53
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娇桥

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 明月照清渠 at 2012-12-18 23:04:53
把序号改成1就行了~

你好，我也出现了相同的问题，你说的把序号改成1 是什么意思啊？我不太懂，能详细的解释一下么？比如我有两个输入的小分子的itp 文件，我是要把两个的原子序号都改成1 么？
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4楼2017-12-27 17:02:06
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