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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助大神关于蛋白质组学研究问题—万分感谢
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yandong1023

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助大神关于蛋白质组学研究问题—万分感谢

2-DE与质谱联用和液质联用路线是蛋白质组学分析的两大主要方法，分别是在蛋白质水平和多肽水平上进行蛋白质组学分析，2-DE与质谱联用路线能否在多肽水平进行分析，液质联用路线能否在蛋白水平进行分析，如果不行，请说明理由，如果可行，请说明技术路线。
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1楼 2012-12-13 14:31:03
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DBWJ

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

2-DE质谱技术因为2-DE对于多肽起不到很好的分离作用，个人认为2-DE质谱应用于多肽水平不可行。
首先2-DE的分离蛋白主要是靠等电点和分子量，而对于10KD以下的蛋白分离效果就很差强人意了
所以对于多肽来说本身分子量就小，基本上用2-DE很难分离的
液质联用路线在蛋白水平是可行的
大蛋白可以酶解成多肽在做MS/MS
我知道的就这么多了
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8楼2013-09-06 13:10:10
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yandong1023

新虫 (初入文坛)
2楼2012-12-13 15:36:30
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wchuangqi

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 很对 2012-12-14 08:03:22
我不知道你为什么要问这个问题。因为就像你说的，2D和质朴一般是做蛋白，由于多肽一般比较小，所以多肽的话都是用液质连用的，因为液质连用前需要用蛋白酶处理蛋白成为多肽。真正质朴的时候，2D也是需要酶解的。因此需要根据你的实验目的，选择合适的方法。
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天道酬勤
3楼2012-12-14 07:47:38
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个2D GEL都可以和LCMS/MS联用的，如果样品中蛋白质成分很复杂的话，需要用2D GEL分离下。
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4楼2012-12-14 08:04:35
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