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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » qPCR怎样算出2-ΔΔCT值，还有标准差的那种？
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summer2771

木虫 (正式写手)

[求助] qPCR怎样算出2-ΔΔCT值，还有标准差的那种？

求助，像我这样的数据，怎么能够在Con和Treat组都得到3个2-ΔΔCT值啊？
我自己琢磨着如果都是用treat跟Con比较的话，那等于说从6个中选2个出来两两比较，不是不止3个值了吗？
虽然2-ΔCT值也能用来比较，但是我还是想用2-ΔΔCT法，请大家指教！不胜感激！

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1楼 2012-12-08 20:16:31
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
引用回帖:
5楼: Originally posted by summer2771 at 2012-12-08 21:00:00
我知道样品的ΔCT=Average样品-Average内参，ΔΔCT=ΔCT-Control样品的ΔCT。但是我的理解是，如上面的数据
比如对照组和实验组的ΔCT是
       1       2        3
对照组7.27  7.03  7.55
实验组10.13 10.23 ...

你理解错了，不是你理解的这样，不能那一个均值随意减去另外一个均值，你要拿特定的基因的Ct值，在两个样品中相减，比如用你这组数据
你这里的1，2，3实际上代表的是gene1，gene2，gene3

     gene1，gene2，gene3
对照组7.27  7.03  7.55
实验组10.13 10.23 10.56

所以只能gene1 的Ct值相减，你拿gene1的对照组Ct值与gene2实验组Ct值相减是不对的
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
6楼2012-12-08 21:12:42
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
楼主问题描述的不清楚，哪个是你的内参，哪个是目的基因Ct值

各样品先要把内参调齐然后再 比较，才有意义，照现有的数据，楼主这组数据中包含一个内参基因和两个目的基因？得到两个2-ΔΔCT值
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2012-12-08 20:29:03
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summer2771

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2012-12-08 20:29:03
楼主问题描述的不清楚，哪个是你的内参，哪个是目的基因Ct值

各样品先要把内参调齐然后再 比较，才有意义，照现有的数据，楼主这组数据中包含一个内参基因和两个目的基因？得到两个2-ΔΔCT值

版主好！
我的第一列是目的内参CT，第二列是内参CT
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3楼2012-12-08 20:42:43
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summer2771

木虫 (正式写手)
版主，我的第一列是目的CT值，第二列是内参CT值！
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4楼2012-12-08 20:52:45
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